其他行業比，首先種業專業性較強，發現侵權案件具有滯後性，對舉報、報案的依賴性較強，農戶維權意識淡薄，所以線索發現難。其次，假種子鑒定難、認定難，司法鑒定機構少、收費高，難以確定損失數額和因果關系。第三取證難，現場易毀損，時效性強導致物證易滅失。
《刑法》第三章第七節侵犯知識產權罪中，對侵犯商標權、專利權、著作權和商業秘密的違法行為均規定了相應的罪名，而植物新品種權屬於知識產權範疇，應給予其與其他智力成果同等的尊重。