二者範圍不同。投資總額是外商投資企業法中的特有概念，在內資企業中並不存在投資總額的概念。註冊資本，是指合營企業在登記管理機構登記的資本總額，是合營各方已經繳納的或合營者承諾壹定要繳納的出資額的總和。
法律依據
《中華人民***和國公司法》
第二十六條 有限責任公司的註冊資本為在公司登記機關登記的全體股東認繳的出資額。
法律、行政法規以及國務院決定對有限責任公司註冊資本實繳、註冊資本最低限額另有規定的，從其規定。
第二十七條 股東可以用貨幣出資，也可以用實物、知識產權、土地使用權等可以用貨幣估價並可以依法轉讓的非貨幣財產作價出資；但是，法律、行政法規規定不得作為出資的財產除外。
對作為出資的非貨幣財產應當評估作價，核實財產，不得高估或者低估作價。法律、行政法規對評估作價有規定的，從其規定。