1，有些軟件技術支持需要A公司配合，學校對A公司有約束力，而妳沒有。
2.有些變更可能要經過A公司同意，否則可能侵犯對方的知識產權，目的是合理規避自身風險。
三方協議中列出了A公司需要配合的事項，相關變更由A公司授權並同意..而且妳可以和學校，也就是學校明確責任和義務:妳需要完成什麽，完成的時間，後期維護等等。而且妳要確定應收賬款是學校正常支付的。
由於妳的實際情況不清楚，只能回答這麽多。