從您描述的情況來看,代理公司的做法涉嫌違反了以上的規定。如果代理公司私自撤回發明人的專利申請文件,在未經發明人同意的情況下改變申請人信息再重新提交,這種做法實際上是在虛構事實,故意誤導知識產權管理部門,這樣的行為顯然是違法的。
因此,建議您盡快聯系專業律師進行咨詢和維權,同時向知識產權管理部門投訴該代理公司的不當行為,維護您的合法權益。