1、由於材料比較繁雜，欲申請認定為高新技術企業，應盡量提早準備；
2、應按照《工作指引》[2]的要求，仔細對照檢查是否符合認定條件；
3、出具研發費用專項審計報告和高新技術產品（服務）收入專項審計報告時，註意選擇經認定主管部門備案的會計師事務所，且研發項目和銷售合同必須屬於企業的主營業務領域。
4、所有提供的材料的證據必須提供足夠的、有說服力的佐證材料，例如：知識產權證明的所有人必須是申請企業，必須在有效期內等。
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