1.缺乏專業化和創新意識:對特殊條件下的關鍵指標重視不夠，沒有圍繞某壹特殊條件有針對性地發展，沒有與企業自身優勢相結合，導致關鍵指標缺失，或者關鍵指標不太硬，難以被認定為“專業化和創新型”中小企業。
2.缺乏多層次、系統化的支持體系:雖然河南省對省市“專精創新”企業有支持政策，但這些政策缺乏多層次、系統化的支持體系，對不同類型、不同發展階段的支持不夠準確。
3.產業鏈存在諸多斷點和阻滯點:河南省“專精創新”企業在產業鏈上存在諸多斷點和阻滯點，尤其是壹些關鍵領域和環節，缺乏核心技術和自主知識產權，需要加強自主研發和創新能力。