1.應用領域不同:價格指數法主要用於宏觀經濟分析，如通貨膨脹率、經濟增長率，以及市場分析，如市場供求、價格波動等。，而功能價值類比法更側重於根據參考對象的交易價格估算評估對象的價值，考慮參考對象與評估對象的功能差異，常用於資產評估和企業營銷策略制定。
2.目的不同:價格指數法的目的是通過反映壹定時期內商品或服務的價格變化來研究通貨膨脹和經濟增長對市場和經濟的影響，而功能價值類比法的目的是通過比較參考對象和估價對象的功能差異來估計估價對象的價值，從而實現資產價值最大化。