根據海運365上貨運知識壹欄板塊的解釋，這三者的區別主要是在於：
海關
主要負責出入境監管、征稅、打私、統計，對外承擔稅收征管、通關監管、保稅監管、進出口統計、海關稽查、知識產權海關保護、打擊走私、口岸管理等主要職責。
出入境檢驗檢疫
由原來的中國商品檢驗局(簡稱商檢)，中華人民***和國衛生檢疫局(簡稱衛檢)，中國動植物檢疫局(簡稱動植檢)三個機構組建而成，是負責出入境衛生檢疫、動植物檢疫和商品檢驗的行政執法機構。
邊檢
是國家設在對外開放口岸，依法對出境、入境的人員及其行李物品、交通運輸工具及其載運的貨物實施檢查、監護和管理的行政執法機關，肩負著維護國家主權、安全和社會秩序的重大使命，承擔著便利人員往來、展示文明國家窗口形象的重大職責。
希望對您有所幫助！