園區有江蘇發起的南京軟件園、南京生物醫藥谷,江蘇最早獲批的國家動漫產業基地,全國首個中國南京留學人員創業園。園區註冊企業絕大多數為科技型企業,70%以上擁有自主知識產權。2011年,園區高新技術產業產值達到980億元,占規模以上工業總產值的76.8%。
作為我市實施創新驅動戰略的主戰場,南京高新區致力於構建產學研壹體化科技創新體系,形成以支持自主知識產權為導向的政策體系和以人為本的創新創業環境。國家級孵化器3個,在孵企業1000多家,畢業企業400多家。