企業知識產權申請的方式包括兩種：委托給專利代理機構辦理申請手續、自主申請。這兩種方式需根據每家企業的實際情況進行選擇，比如企業知識產權每年申請量較少，可以全權委托給專利代理機構，比較省心，還可以節省人資成本；如果企業知識產權每年申請量較大，且對知識產權管理水平要求較高，那麽企業需要培養或引進專業的知識產權管理人才，並進行自主申請及管理。
委托給專利代理機構辦理申請：企業需要指定壹名具體的專職人員，負責與專利代理機構對接，辦理相應的協議簽訂、費用請款、知識產權資料接收工作。
知識產權自主申請：這就需要企業培養或引進專業的知識產權管理人員，甚至應當成立專門的知識產權管理部門，來完成對企業知識產權的分析、檢索、申請、維護工作。