1、申請人將商標註冊申請提交至歐盟知識產權局，直接向歐盟知識產權局申請又分為在線申請和紙質申請，在線申請費用更低且只需使用壹種語言。
2、歐盟知識產權局在收到商標申請後，對商標申請文件進行審查，審查其是否具有可註冊性、是否與在先申請商標存在相同或相似、文件是否完整等。發現問題將通知申請人在2個月內進行補正，未能在規定時間內補正的，歐盟知識產權局將全部或部分駁回申請或主張。通過審查的商標文件將被授予申請日和申請號。
3、歐盟知識產權局審查不存在問題的，註冊申請將被公開在歐盟商標公報上。任何人認為申請註冊的商標損害其在先權利的，可以在申請公開1個月後的3個月內提出異議，歐盟知識產權局將組織雙方程序並將最終做出決定。
4、在規定時間內沒有人提出異議(意見)或者異議(意見)不成立的，歐盟知識產權局將對商標進行註冊，並在歐盟商標公報上公開下發給商標電子註冊證。