根據《高新技術企業認定管理辦法》，國家高新技術企業采用評分制，滿分100分，其中自主知識產權30分，科技成果轉化能力30分，研發組織管理水平20分，企業成長性20分。其中，財務指標主要與企業成長性相關，以企業近三年總資產與銷售收入的加權比率為基礎，其具體分值以增長率的高低來衡量。另壹個財務指標是企業研發費用占比和企業高新技術產品收入占比。這兩項雖然不占分數，但都是硬指標，必須嚴格按照《認可管理辦法》的規定執行。也有很多企業認為，如果企業的成本大於企業的收益，就處於虧損狀態，不可能申請高新技術企業。其實這種觀點是錯誤的。國家認定高新技術企業的政策目的是從戰略上考慮，鼓勵企業創新，鼓勵和支持企業進行自主知識產權研發。在公司成立初期，很多企業的前期R&D成本和土地廠房建設成本占比較大，但是銷售收入很少，所以會有虧損。只是對高新技術企業最大的優惠是稅率的降低，與虧損企業相比意義不大。但如果企業通過綜合考慮發展壯大，虧損可以向國家高新技術企業申報。
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