科技型中小企業技術創新項目必須符合國家產業技術政策，科技含量高，國內領先，自主研發，創新能力強，知識產權清晰，分為創新項目和重點創新項目兩類。創新基金的目的首先是支持技術創新。創新基金支持的項目應具有自主知識產權，要求在技術、工藝或產品性能上有重大創新或實質性改進，技術水平至少達到國內或國際領先水平。
申報工作采取網上申報和紙質材料申報相結合的方式。書面申請材料及相關附件裝訂成冊，壹式兩份，由推薦單位郵寄至創新基金管理中心受理辦公室，項目電子申請材料通過科技部門戶網站提交。
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