保稅店是壹種特殊的進出口貿易形式，由於其涉及到商品的海關清關，所以保稅店清關是非常重要的環節。保稅店清關是指在海關監管下對保稅品進行檢驗、審核、統計、驗放以及計稅等程序，從而使進口保稅貨物合法地進入中國市場。保稅店清關是保稅品安全進入中國市場的必要保障，也是保障海關稅收的有效手段。
保稅店清關需要的手續和程序相對復雜，具體包括備案登記、倉庫監管、貨物統計管理、進境報關、檢驗檢疫、出境報關等多個環節。同時，保稅店還需嚴格遵守壹系列法律法規，如稅法、海關法、知識產權法等規定。只有執行嚴格的海關進口清關程序和規定，才能達到保護國家經濟和社會安全的目的。
相比於其他進出口貿易形式，保稅店能夠享受到更為優惠的政策和措施，如減免關稅、延長納稅期限、降低成本等。但是，為了避免違規行為的出現，保稅店需要重視海關清關的過程，積極與海關合作，***同落實好各項保密、安全措施以及稅收管理制度，確保商品依法入關，安全合規地進入國內市場。