申請註冊牡丹新品種具體步驟如下：
1、選擇出具有獨特性狀並符合商業需求的新品種，並了解該品種的特點、性狀、栽培技術等。
2、對申請的新品種進行田間觀測和樣品檢測，在不同地點和季節進行考察，收集並整理記錄數據；並進行新品種的營養生長繁殖觀察，並進行數據分析和評價；
3、準備申請牡丹新品種註冊所需資料，如試種申請書、實驗結果資料、特別推薦信等，提交申請材料到有關認證機構，如國家林業局、國家知識產權局等。
4、機構會對申請的新品種進行審查和審核，包括品種特性、營養生長繁殖觀察結果等方面的評估，如果符合註冊條件，則通過審核並批準註冊。
5、申請人征得新品種的原產地或原育種組織同意後，便可以依據批準的註冊證書進行生產、銷售等商業化利用。
牡丹新品種註冊需要遵循國家的相關法律法規，嚴格按照規定進行，才能保障新品種的合法權益，並為農業增產和推動農業經濟發展做出更大的貢獻。