北京市房山區人民法院現設有立案壹庭、立案二庭、刑事審判庭、未成年人審判庭，民事審判壹庭、民事審判二庭（商事審判庭）、民事審判三庭（勞動爭議審判庭）、行政庭、知識產權庭、家事法庭，長陽、竇店、長溝、河北、燕山、城關6個人民法庭，執行局（含執行壹庭、執行二庭、執行三庭），辦公室、政治處、檔案科、研究室、監察室、審判監督庭、審判管理辦公室、訴訟服務辦公室、司法警察大隊、裁判文書校核辦公室等***計32個部門。