公司股東變更，首先必須繳納股權轉讓印花稅，如果公司有盈利自然人股東還要就盈利部分繳納個人所得稅。
壹、根據中華人民***和國個人所得稅法規定
自然人股權轉讓行為，轉讓方需要按“財產轉讓所得”計征個人所得稅，如果轉讓方以原價轉讓的，不交個人所得稅。
股權轉讓的雙方要按萬分之五稅率繳納印花稅，對於股權轉讓所得，如果股東是自然人，要按20%稅率繳納個人所得稅，如是法人股東，要按25%稅率繳納企業所得稅。
股東出讓股權，壹般來講公司權益沒有變化，企業壹般不用繳納所得稅
二、七種情形的股權轉讓要交稅
出售股權
公司回購股權
發行人首次公開發行新股時，被投資企業股東將其持有的股份以公開發行方式壹並向投資者發售
股權被司法或行政機關強制過戶
以股權對外投資或進行其他非貨幣性交易
以股權抵償債務
其他股權轉移行為