長期以來，基於開放性網絡的電子商務，由於電子線路的可竊聽性、電子信息的可復制性以及互聯網軟、硬件存在的壹些缺陷，致使黑客攻擊、病毒侵害、網上欺騙、網上盜竊等非法現象時有發生，加之人們的安全防範意識還比較淡薄，電子商務的安全性(包括信息的保密性，完整性，有效性，不可抵賴性，交易身份的真實性)受到質疑，大大降低了大眾對電子商務的信賴程度，阻礙了電子商務的快速發展。
對策：電子商務的安全問題包括(在線動態的)交易活動和(非在線靜態的)商務信息的安全問題。為提高兩方面的安全可靠性，信息技術研究機構和應用開發商應本著利國利民、勇於創新的原則，研究和創新提高電子商務安全性的新技術和新措施。
2技術問題——電子商務能否持續發展問題
信息技術的多樣化快速發展，致使電子商務平臺的開發技術五花八門，造成電子商務平臺彼此不能協調壹致，甚至商務信息無法交流和傳輸。
對策：為了維護國家的利益和經濟安全，在電子商務相關技術方面壹定要註重自主知識產權技術的開發和研究，各級研究機構和應用開發商應加大科研投入、研發擁有自主知識產權的軟件開發技術，要盡快打破在軟件技術上對國外的依賴；國家和地方政府要加大對電子商務新技術開發成果的獎勵和推廣力度；要積極與外國政府和組織合作，建立全球電子商務系統。
3經濟與費用問題——電子商務的效益問題
電子商務的重要內容和標誌是資金支付的電子化，即資金流在網絡上的實現。壹是網上支付的效率不高，確認支付的時間還比較長；二是網上支付收取的費用過高。高昂的電子商務平臺的運行費用和居高不下的支付費用，嚴重影響了電子商務的快速發展。
對策：電子商務系統運營商應進壹步加強與企業、社會投資機構的聯合，走合作開發或合資經營的道路，降低運營成本和交易成本。此外，應適當調低電子商務的網上支付費用，刺激和鼓勵電子商務的發展。
4電信體制問題——電子商務發展的環境保障問題
長期壟斷的電信體制、條塊分割體制，致使我國的幾大主幹網絡不能有機地協調和統壹，互聯網的效用沒有得到最大限度的發揮，影響了電子商務的大發展。
對策：首先要真正打破電信業的行業壟斷局面、克服區域條塊分割現象，盡快實現真正意義上的多網合壹、協作發展，而不是目前的形為“轉制”，而實為妳死我活的競爭局面。
5法律法規問題——電子商務發展的制度保障問題
電子商務是信息時代的新生產業，現有的法律法規修訂滯後，導致電子商務中出現的新型違規或犯罪行為，因無法可依而得不到懲治。
對策：雖然我國的電子商務法、數字簽名法已經實施，但是，在電子商務發展中出現的新型違規和犯罪行為，在很多其他法律和地方法規中還沒有及時得到修訂和明確化、甚至殘缺，要盡快修訂、完善各級各類法律法規，制定與電子商務相關的專用法律或法規，為電子商務的健康、快速發展保駕護航。
6觀念問題——電子商務的人文保障問題
長期的基於“現實世界”的傳統商務模式在社會大眾的商務行為意識中根深蒂固，人們對電子商務這種在“虛擬網絡”環境下的電子交易方式心存疑慮，企業、公眾對電子商務的信心有待提高。
對策：解除社會大眾對電子商務的困惑，壹方面要加強安全保障技術和措施的研發力度，切實提高電子商務系統抵禦惡意攻擊和病毒的危害的能力；另壹方面要在信息化基礎設施建設方面加大投入，為電子商務的深入發展廣開便利之門；第三，在法律法規健全方面增強實效性，加大對非法行為的懲治力度；第四，鼓勵全民上網，普及計算機應用，形成社會發展基礎。只有電子商務系統更安全、更便利、無後顧之憂了，電子商務的主體對電子商務的可信度和可依賴度才能提高，電子商務才能迎來大發展。
7隱私權的保護問題——電子商務發展中的主體權益保障問題
因互聯網固有的開放性特性和現有網絡安全技術的局限性，電子商務主體的隱私權得不到可靠的保證，侵權事件屢有發生。
對策：必須加大研發力度，提高網絡安全技術水平和電子商務系統的安全技術水平，才能切實保護公眾在電子商務活動中的隱私權不受侵犯，增強電子商務主體的信心。
8基礎設施問題——電子商務發展的基石問題
信息基礎設施是電子商務發展的物質基礎和載體，受國情所限，我國不同地區經濟狀況差異較大，在信息基礎設施建設上的整體投入比例與國外相比還比較低，信息基礎設施還比較落後，導致上網速度低和上網費用高。
對策：信息基礎設施的建設需要政府和業界的***同努力，尤其是政府的大力投資和宏觀調控；此外，應鼓勵開展提高網絡軟硬件能力的建設和競爭；第三，要加速發展信息化產業。
9標準問題——電子商務發展的規範化約束問題
電子商務的數字簽名、身份認證、協議與加密算法等的不統壹是制約電子商務跨平臺、跨行業、跨地區，甚至跨國界運行的又壹障礙。
對策：在與國際電子商務有關標準接軌的前提下，制定適合與我國國情的電子商務國家標準、協議和規則，使我國電子商務盡快標準化和規範化。但是，在標準問題上，既不能完全照搬和盲目遵照國外標準，又要考慮到與國際標準的接軌。
10人才問題——電子商務發展的人力保障
目前，我國高校中開設電子商務本科專業的有350多所、專科的有700多所，但是，由於電子商務是壹個新興的學科，國家缺少必要的指導，致使教學計劃混亂、人才培養目標不明，相當比例的畢業生難以適應電子商務發展的需要，人才短缺局面得不到緩解。
對策：我國電子政務與電子商務專業教學指導委員會已經成立，教指委應該結合我國電子商務人才的需求狀況，發揮人才培養指揮棒的作用，盡快規範專業人才的培養計劃、明確培養目標，提高人才培養質量。此外，應積極參與國際人才交流，吸引國際壹流人才。
11政府引導問題——電子商務發展的目標導向
目前，不少研究機構和軟件開發商紛紛將註意力轉向電子商務，但由於缺乏政府及時、積極的正確引導，導致平臺多樣化、規範標準不統壹、大規模低水平重復開發等，致使電子商務不能朝著規範化、協調統壹的方向快速發展。
對策：首先，政府部門應率先施行網上作業和電子政務：此外，國家應設立專門指導機構，制定我國電子商務發展框架和政策法規，地方政府也應設立在國家統壹框架下的構建區域電子商務管理與指導部門，這樣，由上而下形成壹個縱向的引導體系，統壹規劃、統壹實施，加速電子商務在我國的快速發展；制定優惠政策，積極引導和推進企業信息化，鼓勵企業開展電子商務。
12電子商務的國際化問題
我國已經成為WTO的成員國，但是，目前國內很多中小企業甚至壹些大企業，還沒有構建自己的電子商務平臺，制約了走出國門，與國際交流和合作的機會，不能適應全球經濟壹體化的大趨勢。
對策：加快國內企業實施基於B2B的電子商務模式的步伐，加強電子商務領域的國際合作，謀求建立全球電子商務體系。
13電子商務發展的切入點問題
雖然我國電子商務已經開展多年，但可以說尚處於“朦朧”的階段，表現為“壹哄而上”，亮點不多，發展緩慢，成效不夠顯著。
對策：應結合我國國情，針對行業或地區市場經濟條件和信息化基礎設施條件的差異，鼓勵試點，在取得經驗的基礎上逐步推開，進而帶動和促進我國電子商務的發展。
14物流不暢問題
物流配送是電子商務中主要環節之壹，直接影響著交易的最終實現。而我國加工和存儲貨物的集裝箱、工廠、倉庫和中轉站配套不完善，公路鐵路和水運空運的運輸靈活性不夠，各運營地區地方保護主義的壹些規章制約，給電子商務公司造成巨大的財政和效率壓力，制約了電子商務的發展。
對策：應加快構建現代物流網絡體系，簡化物流環節，克服條塊分割現象，提高物流效率。
15電子商務的稅務問題
稅務是壹個國家重要的財政來源。由於電子商務的交易活動是在沒有固定場所的國際信息網絡環境下進行，造成國家難以控制和收取電子商務的稅金。
對策：存制定與電子商務有關的政策法規時，需要重新審視傳統的稅收政策和手段，建立新的、有效的稅收機制。
16信用問題——制約電子商務發展的重要因素
由於網絡具有虛擬等特點，電子商務環境下的商業信用有了新的內容和要求，電子商務使社會信用問題更加突出，欺騙與欺詐行為、抵賴行為時有發生，社會信用環境岌岌可危，制約了電子商務的發展。
對策：在全社會範圍內進壹步加強誠信道德宣傳和教育，在商家和消費者的***同努力下，逐步在電子商務領域建立壹套完善的信任機制和體系，營造良好的社會信用環境。