集種牛繁育、種公牛優質冷凍精液生產、奶牛胚胎生產、奶牛育種技術研究於壹體。是全國唯壹的國家奶牛胚胎工程技術研究中心和國家牛冷凍精液質量檢驗中心。是目前國內最大的奶牛基因庫。
北京中公牛站
它隸屬於北京奶牛中心，自60年代成立以來，在奶牛遺傳育種和冷凍精液生產方面做了大量的研究工作。種公牛站擁有180頭國內最高水平的優秀種公牛，包括“黑星”、“雷達”等世界著名公牛的後代。是目前國內最大的優良奶牛基因庫，形成了國際先進的優良種公牛育種方案和技術路線。在種牛建立、後備公牛選育、種公牛遺傳評估等方面，利用自有科研成果，制定了適合北京和全國的育種標準和工藝流程。使北京成為中國第壹個按照國際標準自主繁育優良公牛的地方。公牛育種站經過九年努力研究公牛育種冷凍精液生產效率，先後攻克了公牛育種管理、潤滑劑研制、稀釋液配方選擇、冷凍平衡時間等被發達國家封鎖的關鍵技術。北京種公牛站生產效率比全國種公牛站高2倍以上，在全國和北京推廣了14萬劑優質冷凍精液。年產量約400萬劑，覆蓋北京、天津、華北、西北等11個省市，占全國牛冷凍精液的1/4，全部使用北京種公牛站優質冷凍精液。優質冷凍精液使奶牛產奶量提高了壹倍多，使京郊奶牛質量在全國名列前茅。
北京奶牛基因工程技術中心
隸屬於北京奶牛中心，主要任務是將現代遺傳育種方法和育種技術應用於我國奶牛的遺傳改良和繁殖，開展牛的優良品種選育、快速繁殖和推廣。奶牛生物技術的研究和發展。如x.y精子分離技術和體細胞克隆技術研究成功，克隆的公牛也以朱镕基同誌命名。特別是種牛隱性有害基因檢測方法的研究取得了很大進展。
三元食品研發中心
成立於8月，1995，由科研、培訓、中試工廠組成。2000年被北京市經委認定為市級企業技術中心。技術中心現有員工78人，其中博士2人，博士生2人，碩士、中高級技術人員占50%以上。2002年10期間，國家人事部確認並批準成立了國內唯壹的乳業企業博士後研究中心。主要承擔全公司新產品開發、生產、銷售的技術支持，承擔全員培訓。
目前，該中心正在承擔5項國家重大科研項目和2項北京市科研項目。包括國家重點技術創新項目、國家十五重大科技攻關項目、國家十五重大科技專項、農業部農業產業化項目等。為市場開拓和公司發展提供了強有力的產品和技術保障。
北京養豬中心
是國家規模化種豬繁育基地。中心設有種豬資源場、原種豬場、種豬性能檢測站、SPF(無特定病原體)種豬場。利用專業化品系選育技術和配合力測定，篩選出我國生長繁殖性能突出的豬雜交組合，開發出配套系選育成套技術，成功育成具有自主知識產權的“中育配套系”種豬，通過國家品種委員會審定，該技術處於全國領先水平。
SPF養豬技術是國內唯壹壹項將SPF技術的研究與應用相結合的技術。SPF豬生產體系的推廣首先阻斷了多種疾病；其次，種豬資源得到充分保護和利用，避免從國外重復引進；同時可以大大提高養豬的生產效率。該中心探索出了適合中國國情的SPF豬生產技術，建立了核心群體，成為中國種豬市場的名牌產品。SPF是中國養豬業的前瞻性技術。可作為壹項高新養殖技術在京郊推廣，將大大提高北京市商品豬場的飼養水平。
北京金星鴨業中心
是集北京鴨養殖、肉鴨養殖、屠宰加工、市場銷售為壹體的大型養殖企業。其南口種鴨場是北京鴨品種資源保護和良種推廣的唯壹基地。
多年來，中心堅持國內家禽業配套系的育種方向，采用封閉群家系選擇與優良個體選擇相結合的育種方法，走專業化品系培育之路，不斷提高北京鴨的生產性能。先後培育出8個北京鴨專用品系，選育出2個北京鴨配套品系，滿足了北京填鴨和分裂肉鴨的生產需要，北京鴨良種已推廣到全國20多個省市。
在北京鴨育種中心，用北京鴨完成了世界首個鴨遺傳圖譜，被FAO推薦為鴨研究的遺傳標記，為北京鴨的分子育種、品種資源和知識產權保護奠定了基礎。
太陽藥業公司企業技術中心
是北京太陽藥業股份有限公司的研發機構，2000年被北京市經委認定為市級企業技術中心。該中心擁有壹支由工程院院士、博士和碩士組成的高素質R&D團隊。在不斷提升R&D能力的同時，太陽藥業廣泛加強與著名科研機構的合作，在全球矚目的藥物領域開展研究。該中心與科研院所聯合研制出市場占有率較高的抗菌消炎藥物阿奇黴素後，歷時5年研制出治療ⅱ型糖尿病的新藥愛婷，並已推向市場。
北京利士達獸藥公司
是市科委認定的星火計劃科技試點示範企業。公司研制生產的系列獸藥在北京郊區和國內部分省市銷售。不久前，公司完成了GMP認證，為公司發展和產品市場開拓提供了有利保障。