1、企業所得稅
（1）國家需要重點扶持的高新技術企業按減15%的稅率征收企業所得稅。國家需要重點扶持的高新技術企業是指擁有核心自主知識產權，並同時符合《高新技術企業認定管理辦法》（國科發火［2008］172號）規定條件的企業。
文件依據：《中華人民***和國企業所得稅法》及其實施條例、《高新技術企業認定管理辦法》（國科發火［2008］172號）。
操作流程：上述減免稅項目需要備案。納稅人應在匯算清繳期內，按主管稅務機關的要求報送備案資料。報送資料包括：有效的高新技術企業證書（加蓋公章的復印件）；主管稅務機關要求報送的其他資料。
（2）企業的開發新技術、新產品、新工藝的研究開發費用支出，可以在計算應納稅所得額時加計扣除。研發費用的加計扣除是指企業為開發新技術、新產品、新工藝發生的研究開發費用，未形成無形資產計入當期損益的，在按照規定據實扣除的基礎上，按照研究開發費用的50%加計扣除；形成無形資產的，按照無形資產成本的150%攤銷。
文件依據：《中華人民***和國企業所得稅法》及其實施條例、《國家稅務總局關於印發＜企業研究開發費用稅前扣除管理辦法（試行）＞的通知》（國稅發［2008］116號）。
操作流程：上述減免稅項目需要備案。納稅人應在匯算清繳期內，按主管稅務機關的要求報送備案資料。報送資料包括：自主、委托、合作研究開發項目計劃書和研究開發費預算（加蓋公章的復印件）；自主、委托、合作研究開發專門機構或項目組的編制情況和專業人員名單；自主、委托、合作研究開發項目當年研究開發費用發生情況歸集表；企業總經理辦公會或董事會關於自主、委托、合作研究開發項目立項的決議文件（加蓋公章的復印件）；委托、合作研究開發項目的合同或協議（加蓋公章的復印件）；研究開發項目的效用情況說明、研究成果報告等資料；主管稅務機關要求報送的其他資料。
（3）創業投資企業從事國家需要重點扶持和鼓勵的創業投資，可以按投資額的壹定比例抵扣應納稅所得額。抵扣應納稅所得額是指創業投資企業采取股權投資方式投資於未上市的中小高新技術企業2年以上的，可以按其投資額的70%在股權持有滿2年的當年抵扣該創業投資企業的應納稅所得額；當年不足抵扣的，可以在以後納稅年度結轉抵扣。
文件依據：《中華人民***和國企業所得稅法》及其實施條例。
操作流程：上述減免稅項目需要備案。納稅人應在匯算清繳期內，按主管稅務機關的要求報送備案資料。報送資料包括：抵扣資格備案：①經有權部門批準認定的創業投資企業證書或文件（加蓋公章的復印件）；②被投資的中小高新技術企業的高新技術企業證書（加蓋公章的復印件）；③投資合同、協議及實投資金驗資證明（加蓋公章的復印件）；④被投資的中小高新技術企業未上市的聲明；⑤主管稅務機關要求報送的其他資料。抵扣應納稅所得額備案：①經有權部門批準認定的創業投資企業證書或文件（加蓋公章的復印件）；②被投資的中小高新技術企業的高新技術企業證書（加蓋公章的復印件）；③投資合同、協議及實投資金驗資證明（加蓋公章的復印件）；④創業投資企業抵扣應納稅所得額備案明細表；⑤主管稅務機關要求報送的其他資料。
（4）符合條件的技術轉讓所得，可以免征、減征企業所得稅。符合條件的技術轉讓所得免征、減征企業所得稅，是指壹個納稅年度內，居民企業技術轉讓所得不超過500萬元的部分，免征企業所得稅；超過500萬元的部分，減半征收企業所得稅。
文件依據：《中華人民***和國企業所得稅法》及其實施條例。
操作流程：上述減免稅項目需要備案。納稅人應在匯算清繳期內，按主管稅務機關的要求報送備案資料。報送資料包括：經科學技術行政部門認定登記的技術轉讓合同（加蓋公章的復印件）；技術轉讓合同認定登記證明和認定登記表（加蓋公章的復印件）；實際發生的技術性收入明細表；項目所得核算情況聲明；主管稅務機關要求報送的其他資料。
（5）企業的固定資產由於技術進步等原因，確需加速折舊的，可以縮短折舊年限或者采取加速折舊的方法。可以采取縮短折舊年限或者采取加速折舊的方法的固定資產，包括：由於技術進步，產品更新換代較快的固定資產；常年處理強震動、高腐蝕狀態的固定資產。采取縮短折舊年限方法的，最低折舊年限不得低於條例第六十條規定折舊年限的60%；采取加速折舊方法的，可以采取雙倍余額遞減法或者年數總和法。
文件依據：《中華人民***和國企業所得稅法》及其實施條例。
操作流程：納稅人自行計算減免稅。
（6）示範區內的創新企業發生的職工教育經費支出，不超過工資薪金總額的部分，準予在計算應納稅所得額時扣除；超過部分，準予在以後納稅年度結轉扣除。
文件依據：《財政部國家稅務總局對中關村科技園區建設國家自主創新示範區有關職工教育經費稅前扣除試點政策的通知》（財稅［2010］82號）。
操作流程：上述減免稅項目需要備案。
（7）企業在示範區內從事《國家重點支持的高新技術領域》、國家發展和改革委等部門公布的《當前優先發展的高技術產業化重點領域指南（2007年度）》和中關村國家自主創新示範區當前重點發展的高新技術領域規定項目的研究開發活動，其在壹個納稅年度中實際發生的下列費用支出，允許在計算應納稅所得額時按照規定實行加計扣除。新產品設計費、新工藝規程制定費以及與研發活動直接相關的技術圖書資料費、資料翻譯費。從事研發活動直接消耗的材料、燃料和動力費用。在職直接從事研發活動人員的工資、薪金、獎金、津貼、補貼，以及依照國務院有關主管部門或者北京市人民政府規定的範圍和標準為在職直接從事研發活動人員繳納的基本養老保險費、基本醫療保險費、失業保險費、工傷保險費、生育保險費和住房公積金。專門用於研發活動的儀器、設備的折舊費或租賃費以及運行維護、調整、檢驗、維修等費用。專門用於研發活動的軟件、專利權、非專利技術等無形資產的攤銷費用。專門用於中間試驗和產品試制的不構成固定資產的模具、工藝裝備開發及制造費，以及不構成固定資產的樣品、樣機及壹般測試手段購置費。勘探開發技術的現場試驗費，新藥研制的臨床試驗費。研發成果的論證、鑒定、評審、驗收費用。
文件依據：《財政部國家稅務總局對中關村科技園區建設國家自主創新示範區有關研究開發費用加計扣除試點政策的通知》（財稅［2010］81號）。
操作流程：上述減免稅項目需要備案。
2、營業稅
（1）對單位和個人（包括外商投資企業、外商投資設立的研究開發中心、外國企業和外籍個人）從事技術轉讓、技術開發和與之相關的技術咨詢、技術服務取得的收入，免征營業稅。
文件依據：《財政部、國家稅務總局關於貫徹落實＜中***中央國務院關於加強技術創新，發展高科技，實現產業化決定＞有關稅收問題的通知》（財稅字［1999］273號）。
操作流程：上述減免稅項目需要備案。單位和個人簽訂技術合同後，按照《技術交易免征營業稅備查申報資料清單》，攜帶所需資料到主管稅務所辦理技術交易免征營業稅備查申報手續。資料清單列舉的資料中，除《技術交易免征營業稅業務內容簡要說明》和授權委托書必須為原件外，其余資料可使用復印件，且須加蓋公章。復印件內容必須與原件內容壹致，並在顯著位置加以標註。對持有《受理備案通知書》的單位和個人，應於取得該項技術交易收入的次月月終前，按照《技術交易免征營業稅備查數據資料清單》所列資料，填報《技術交易免征營業稅備查數據表》，連同結算發票或其他合法結算收入證明復印件，壹並報送主管稅務機關備查。
（2）科技企業孵化器是以促進科技成果轉化、增減高新技術企業和企業家為宗旨的科技創業服務機構。自2008年1月1日至2010年12月31日，對其向孵化企業出租場地、房屋以及提供孵化服務的收入，免征營業稅。“孵化服務”是指為孵化企業提供的屬於營業稅“服務業”稅目中“代理業”、“租賃業”和“其他服務業”中的咨詢和技術服務範圍內的服務。
文件依據：《財政部、國家稅務總局關於科技企業孵化器有關稅收政策問題的通知》（財稅［2007］121號）。
操作流程：上述減免稅項目需要備案。納稅人按主管稅務機關的要求報送備案資料，報送資料包括：減免稅備案表；國務院科技行政主管部門出具相應的證明材料。
（3）國家大學科技園是以具有較強科研實力的大學為依托，將大學的綜合智力資源優勢與其他社會優勢資源相組合，為高等學校科技成果轉化、高新技術企業孵化、創新創業人才培養、產學研結合提供支撐的平臺和服務的機構。自2008年1月1日至2010年12月31日，對其向孵化企業出租場地、房屋以及提供孵化服務的收入，免征營業稅。“孵化服務”是指為孵化企業提供的屬於營業稅“服務業”稅目中“代理業”、“租賃業”和“其他服務業”中的咨詢和技術服務範圍內的服務。
文件依據：《北京市財政局北京市地方稅務局轉發財政部國家稅務總局關於國家大學科技園有關稅收政策問題的通知》（京財稅［2007］2332號）。
操作流程：上述減免稅項目需要備案。納稅人按主管稅務機關的要求報送備案資料，報送資料包括：減免稅備案表；國務院科技和教育行政主管部門出具相應的證明材料。
3、個人所得稅
（1）科研機構、高等學校轉化職務科技成果以股份或出資比例等股權形式給予個人獎勵，經主管稅務機關審核後，暫不征收個人所得稅。
文件依據：《國家稅務總局關於取消促進科技成果轉化暫不征收個人所得稅審核權有關問題的通知》（國稅函［2007］833號）。
操作流程：上述減免稅項目需要備案。將職務科技轉化為股份、投資比例的科研機構、高等學校或者獲獎人員，應在授（獲）獎後30日內，向主管稅務機關提交相關部門出具的《出資入股高新技術成果認定書》、技術成果價值評估報告和確認書，以及獎勵的其他相關詳細資料。
（2）對示範區內科技創新創業企業轉化科技成果，以股份或出資比例等股權形式給予本企業相關技術人員的獎勵，技術人員壹次繳納稅款有困難的，經主管稅務機關審核，可分期繳納個人所得稅。
文件依據：《財政部國家稅務總局對中關村科技園區建設國家自主創新示範區有關股權獎勵個人所得稅試點政策的通知》（財稅［2010］83號）。
操作流程：上述減免稅項目需要備案。
4、地方各稅
（1）自2008年1月1日至2010年12月31日，對符合條件的科技園自用以及無償或通過出租等方式提供給孵化企業使用房產、土地，免征房產稅、城鎮土地使用稅。
文件依據：《財政部、國家稅務總局關於國家大學科技園有關稅收政策問題的通知》（財稅［2001］120號）。
操作流程：上述減免稅項目需要備案。納稅人按主管稅務機關的要求報送備案資料，報送資料包括：減免稅備案表；國務院科技和教育行政主管部門出具相應的證明材料。
（2）自2008年1月1日至2010年12月31日，對符合條件的孵化器自用以及無償或通過出租等方式提供給孵化企業使用的房產、土地，免征房產稅、城鎮土地使用稅。
文件依據：《財政部、國家稅務總局關於科技企業孵化器有關稅收政策問題的通知》（財稅［2007］121號）。
操作流程：上述減免稅項目需要備案。納稅人按主管稅務機關的要求報送備案資料，報送資料包括：減免稅備案表；國務院科技行政主管部門出具相應的證明材料。
（三）節能環保產業
企業所得稅
1、企業從事符合條件的環境保護、節能節水項目的所得，自項目取得第壹筆生產經營收入所屬納稅年度起，第1年至第3年免征企業所得稅，第4年至第6年減半征收企業所得稅。符合條件的環境保護、節能節水項目，包括公***汙水處理、公***垃圾處理、沼氣綜合開發利用、節能減排技術改造、海水淡化等。項目的具體條件和範圍由國務院財政、稅務主管部門商國務院有關部門制訂，報國務院批準後公布實施。
文件依據：《中華人民***和國企業所得稅法》及其實施條例。
操作流程：上述減免稅項目需要備案。納稅人應在匯算清繳期內，按主管稅務機關的要求報送備案資料，報送資料包括：有關部門認定的項目證明資料（加蓋公章的復印件）；取得第壹筆收入的相關證明資料，如收款證明、發票存根聯等（加蓋公章的復印件）；項目所得核算情況聲明；主管稅務機關要求報送的其他資料。
2、企業購置用於環境保護、節能節水、安全生產等專用設備的投資額，可以按壹定比例實行稅額抵免。稅額抵勉是指企業購置並實際使用《環境保護專用設備企業所得稅優惠目錄》和《安全生產專用設備企業所得稅優惠目錄》規定的環境保護、節能節水、安全生產等專用設備的，該專用設備的投資額的10%可以從企業當年的應納稅額中抵免；當年不足抵免的，可以在以後5個納稅年度結轉抵免。
文件依據：《中華人民***和國企業所得稅法》及其實施條例、《財政部、國家稅務總局關於執行環境保護專用設備企業所得稅優惠目錄、節能節水專用設備企業所得稅優惠目錄和安全生產專用設備企業所得稅優惠目錄有關問題的通知》（財稅［2008］48號）。
操作流程：上述減免稅項目需要備案。納稅人應在匯算清繳期內，按主管稅務機關的要求報送備案資料，報送資料包括：抵免資格備案：購買專用設備發票及清單（加蓋公章的復印件）；專用設備固定資產使用卡片或專用設備固定資產明細帳（加蓋公章的復印件）；專用設備屬於《環境保護專用設備企業所得稅優惠目錄》、《節能節水專用設備企業所得稅優惠目錄》、《安全生產專用設備企業所得稅優惠目錄》規定的環境保護、節能節水、安全生產等專用設備的聲明、專用設備使用情況聲明；主管稅務機關要求報送的其他資料。抵免稅額備案：購買專用設備發票及清單（加蓋公章的復印件）；專用設備固定資產使用卡片或專用設備固定資產明細帳（加蓋公章的復印件）；企業購置專用設備抵免企業所得稅額備案明細表；主管稅務機關要求報送的其他資料。
3、企業自2008年1月1日起以《資源綜合利用企業所得稅優惠目錄》規定的資源作為主要原材料，且原材料占生產產品材料的比例不得低於目錄規定的標準，生產國家非限制和禁止並符合國家和待業相關標準的產品取得的收入，按減90%計入收入總額。
文件依據：《中華人民***和國企業所得稅法》及其實施條例、《財政部、國家稅務總局關於執行資源綜合利用企業所得稅目錄有關問題的通知》（財稅［2008］47號）。
操作流程：上述減免稅項目需要備案。納稅人應在匯算清繳期內，按主管稅務機關的要求報送備案資料，報送資料包括：有效的《資源綜合利用認定證書》、北京市發展和改革委員會公布資源綜合利用企業認定結果的文件（加蓋公章的復印件）；企業實際資源綜合利用情況（包括綜合利用的資源、技術標準、產品名稱等）、分別核算資源綜合利用收入的聲明；主管稅務機關要求報送的其他資料。