黨中央、國務院高度重視轉基因技術的研究和應用。2006年，培育轉基因生物新品種重大工程被列入《國家中長期科學和技術發展規劃綱要(2006-2020年)》。2008年7月，國務院批準啟動培育轉基因生物新品種的重大工程。2009年6月，國務院發布《關於加快生物產業發展的若幹政策》，提出“加快把生物產業培育成為高技術領域的支柱產業和國家戰略性新興產業”。2010中央1號文件提出“繼續實施培育轉基因生物新品種重大科技工程，抓緊開發具有重要應用價值和自主知識產權的功能基因和生物新品種，在科學評價和依法管理的基礎上，推進轉基因生物新品種產業化”。
目前，農業部會同科技部、發展改革委等轉基因生物新品種培育重大領導小組10成員單位，堅持中央和國務院的總體部署，堅持“加快研究、推廣應用、規範管理、科學發展”的指導方針，堅持“強化自主創新、突出戰略重點、創新管理機制、培育生物產業”的總體思路，堅持產品和產業導向，上中下遊緊密銜接、多部門多學科合作、產品研發和安全性評價協調推進、產業化分步推進的基本原則，加快實施培育轉基因生物新品種重大專項，力爭獲得壹批具有重要應用價值和自主知識產權的基因，培育壹批抗逆性、抗蟲性、 優質、高產、高效，這將為我國農業的可持續發展提供強有力的科技支撐。
加強農業轉基因生物安全管理是推進轉基因技術研究和應用的重要保障。我國政府高度重視農業轉基因生物安全管理，堅持立法先行、有法可依、執法保障，形成了壹套適合我國國情、與國際慣例接軌的法律法規、技術規程和管理體系，依法實施安全管理成效顯著。
第壹，建立和完善法律法規。65438-0996農業部發布《農業生物基因工程安全管理實施辦法》。2001年，國務院頒布了《農業轉基因生物安全管理條例》(以下簡稱《條例》)，對我國農業轉基因生物的研究、試驗、生產、加工、經營、進出口進行全面安全管理。農業部和質檢總局制定了5部配套法規，發布了轉基因生物目錄，建立了研究、試驗、生產、加工、經營、進口的許可和標識管理制度。
二是加強技術體系建設。經農業轉基因生物安全管理部際聯席會議成員單位推薦，農業部成立了農業轉基因生物安全委員會(以下簡稱安委會)和全國農業轉基因生物安全管理標準化技術委員會，35家檢測機構通過了國家計量認證和農業部審批。大力組織開展轉基因生物的分子特性、環境安全和食用安全研究，不斷提高技術支撐能力。目前已發布技術標準62項，保證了依法管理的需要。
第三，科學規範的安全評價。安委會按照法律法規和相關技術標準的要求，參考國際組織制定的評價指南，遵循科學、個案、熟悉的原則，嚴謹規範地開展評價工作。到2009年底，轉基因棉花、番茄、矮牽牛、辣椒、木瓜、水稻、玉米等植物的安全證書獲得批準和頒發。
四是加強行政監督管理。各級農業行政主管部門要加強對田間試驗、品種審定、種子生產經營、產品鑒定等環節的執法監管，大力開展法律法規培訓和科普宣傳，確保各項活動依法有序開展。