權屬不同：商標主要是用來區別不同的商品生產者、經營者提供的商品或服務的，它反映了特定的商品質量、特色或服務，便於人們認牌購買或消費，以防止與他人在同種商品或類似商品及服務上的混淆。商標與其所依附的某些特定商品相聯系而存在，商標權屬知識產權。商號反映了特定的主體身份，主要是用來區別企業的，以避免在各種活動中與其他經營者發生混淆，使公眾誤認。商號與商品的生產者或經營者相聯系而存在，商號權屬名稱權，所以商號權與人身或身份聯系更緊密。
時間效力不同：商標在全國或更大範圍有效。商標權的保護有壹個法定的期限。註冊商標有效期為十年，到期可續展。商號專用權壹般只在登記主管的管轄區域內發生效力（除全國性的企業外）。而商號權的保護沒有法定的期限，商號與企業同生同滅。
適用法律不同：商標在商標局申請註冊，受商標法保護，註冊的時候要符合商標法規定。商號在所屬區域的工商行政管理機關登記，必須按《企業名稱登記管理條件》進行登記才能取得和使用，並按該《條例》規定使用和進行管理。且我國截止2024年3月25日對商號登記是采用“強制登記”的原則，即未經登記的商號不得使用。