1、賣家不同
全球購是海外直郵的產品，京東要求在全球購開店的商家必須是國外的公司及國外的品牌授權，臺灣香港的公司也可以。由此可見在京東全球購購買的的海外產品是有正品保證的；而京東自營貨物由京東采購，提供售後，並開具發票。貨品質量由京東保障。所以由此可見，也是有正品保證的。
2、物流速度不同
京東自營的物流速度要快壹點，而全球購的物流速度由於需海關清關，物流速度會比京東自營慢壹些，但是卻比國際物流快，因為京東全球購在廣州、寧波、上海、重慶、天津落地自營保稅倉，並與杭州、鄭州等多地保稅倉合作保稅備貨。
3、價格不同
全球購上購買的產品在價格方面比自營有優勢，但物流速度會很慢。
擴展資料：
京東全球購賣家權益
1、全球購身份授權：包括官方認證的身份標識，和專門的全球購店鋪體系，以提升您的店鋪榮譽和保障。?
2、有機會參與全球購全年線上線下站內外各種類型的推廣和營銷活動。
3、商品有權進入網站“海外商品”展示。
4、店鋪有權進入網站“全球購店鋪”展示。
5、專業的培養：我們會提供專業的咨詢和指導，幫助每個階段的賣家成長
京東全球購處罰條例
1、發布國產商品但數量小於5件，做刪除處理；數量大於5件情節嚴重者刪除國產商品並取消全球購資格。
2、發布任何違反《淘寶規則》的商品（包括但不限於任何侵犯他人知識產權的物品，視情節輕重，采取商品下架刪除、店鋪扣分及取消全球購賣家資格等處罰措施。
3、上述處罰不影響執行淘寶網的其他規則。
京東官網-京東全球購自營和京東自營區別