員工雖與單位簽訂了保密協議，但協議條款不得與法律法規相抵觸，否則無效。只要舉報內容不涉及產品技術、工藝流程、原料配方等知識產權問題，公司就不能處罰舉報的員工。
如果公司違法，員工有權向司法部門舉報。員工雖與單位簽訂了保密協議，但協議條款不得與法律法規相抵觸，否則無效。只要舉報內容不涉及產品技術、工藝流程、原料配方等知識產權問題，公司就不能處罰舉報的員工。
附件是公司保密系統的樣本。
第壹條為保守公司秘密，維護公司發展和利益，特制定本制度。
第二條所有員工都有保守公司秘密的義務。
第三條在對外交流與合作中，我們必須特別註意不要泄露公司機密，更不要出賣公司機密。
第四條公司秘密是指關系到公司發展和利益，在壹定時期內只為壹定範圍的員工所知悉的事項。公司秘密包括以下秘密事項:
1.公司業務發展決策中的秘密事項；
2.人事決策中的秘密事項；
3.專有生產技術和新生產技術；
4.招標項目的標底、合作條件和貿易條件；
5.重要合同、客戶和貿易渠道；
6.公司非公開金融證券信息及銀行賬號；
7.董事會或總經理認為應當保密的其他公司秘密。
第五條屬於公司秘密的文件和資料應標明“秘密”字樣，並由專人負責打印、收發、傳遞和保管。
第六條公司秘密應當根據需要限定在壹定範圍內。
第七條未經批準，不準復制或摘抄秘密文件和資料。
第八條記載公司秘密事項的工作底稿持有人必須妥善保管。如有遺失，必須立即掛失，並采取補救措施。
第九條凡接觸到公司秘密的員工，未經批準，不得向他人泄露。不接觸公司機密的員工不允許打聽或刺探公司機密。
第十條對保守公司秘密或者防止泄密有功者，應當給予表彰和獎勵。
違反本規定，故意或過失泄露公司秘密的，根據情節和危害後果，給予行政處分或經濟處罰，直至開除出公司。
第十壹條資料室、檔案室、計算機房等保密部門，非工作人員不得隨便進入，工作人員不得隨便帶人進入。
法律依據:
中華人民共和國反不正當競爭法
第十條經營者不得以下列方式侵犯商業秘密:
(壹)以盜竊、利誘、脅迫或者其他不正當手段獲取權利人的商業秘密；
(二)披露、使用或者允許他人使用前款手段獲取權利人的商業秘密；
(三)違反約定或者權利人保守商業秘密的要求，披露、使用或者允許他人使用其掌握的商業秘密。第三人知道或者應當知道前款所列違法行為，獲取、使用或者披露他人的商業秘密的，視為侵犯商業秘密。本條所稱商業秘密，是指不為公眾所知悉，能給權利人帶來經濟利益，具有實用性，並經權利人保密的技術信息和經營信息。