(1)辦公室
綜合協調機關日常工作；審核業務系統級以下人員因公出國任務；負責文電、保密、檔案、信訪、政務公開、固定資產管理、會議、接待和安全保衛工作。
(2)組織人事部門
負責局機關及所屬單位退休人員的人事、組織、管理和服務工作；負責局機關及所屬單位因公出國(境)人員的考核；組織和指導全市商務系統的業務培訓。
(三)綜合法規司(行政審批司牌子)
提出業務發展戰略和政策建議；制定業務發展的中長期計劃；組織重點課題研究；負責業務歷史和年鑒的編寫；起草地方性法規、規章等規範性文件和重要文稿；承辦相關的行政復議和行政訴訟；統壹承辦本部門行政許可和非行政許可審批事項的辦理。
(4)財務審計辦公室
會同有關部門管理國際市場開拓資金和中小企業重點業務扶持資金；監督管理中央外貿發展基金；按規定權限辦理市內企業出口退稅質押貸款的相關業務；落實支持外貿進出口和貿易流通的政策；負責機關及下屬單位的財務、審計和固定資產管理。
(5)市場秩序管理辦公室(掛商務舉報投訴服務中心牌子和商務行政執法辦公室牌子，電話12312)
牽頭協調整頓和規範市場經濟秩序，制定規範流通秩序的政策措施；依法開展流通領域行政執法，參與打擊商務領域知識產權侵權和商業欺詐行為；推進商務領域信用建設，引導商業信用銷售，建立市場誠信服務平臺；組織和規範零售企業促銷行為，引導行業誠信文明服務活動的開展；承擔12312業務舉報和投訴的受理；負責酒類流通的監督管理，並會同有關部門對直銷企業進行行業管理；負責職責範圍內商場、超市的安全生產監管。
(6)市場網絡建設辦公室
引導商業中心、商業服務集聚區、大中型商業網點、大型批發市場和商業街區建設，推進商業流通網絡體系基礎設施建設；負責拍賣業的監督管理；按規定對再生資源回收、汽車流通、二手車交易市場、報廢汽車回收(含拆解)、二手商品流通進行監督管理。
(7)商務服務業發展部
承擔商貿服務業的管理工作；推動連鎖經營、物流配送、電子商務等現代流通方式發展；指導流通企業改革、社區商業發展和流通領域節能降耗工作；負責典當行業的監督管理。
(八)蔬菜副食品辦公室(掛市場運行管理部的牌子)
負責監測和分析全市生活必需品和消耗品的市場供求情況，制定市場調控政策和措施；負責生活必需品市場供應應急管理機制建設；組織協調生活必需品和消費品的儲備和供應；負責組織全市“菜籃子”和“三綠工程”建設；負責全市生豬及其他畜禽屠宰行業管理和屠宰活動的監督管理；承擔市重要商品市場調控工作領導小組辦公室和市“菜籃子”工程建設領導小組辦公室的日常工作。
(9)對外貿易辦公室
協調和管理全市外貿企業的經營秩序；促進對外貿易經營者的發展；指導出口商品的廣告、商標和質量認證；實施出口商品名牌發展戰略；跟蹤分析進出口產品，優化出口產品結構；指導對外經濟貿易領域的中介組織和社會團體工作。
㈩外貿發展辦公室
指導協調各類海外貿易促進機構建設，完善國際市場推廣網絡；宏觀指導和促進各項對外經濟、技術和貿易活動；組織海外銷售推廣和國內采購談判活動；推動互聯網貿易、電子商務、國際連鎖采購等新型貿易方式發展。
(xi)國際服務貿易處
擬定全市外貿發展規劃和外貿平衡的政策措施；監控和分析外貿運作；負責全市進出口業務的統計；協調金融貿易、銀行貿易、外匯貿易和信息貿易方面的合作；制定全市服務貿易和服務外包產業發展的政策和規劃，並組織實施；負責全市服務外包產業及相關服務貿易的統計分析；組織協調全市服務外包產業定向招商。
(12)科技處和機電處(掛市機電產品進出口辦公室牌子)
研究擬定本市機電產品和高新技術產品進出口發展規劃；指導全市國家科技創新基地、機電產品出口基地建設和商務系統科技創新，實施“科技促貿”戰略；協調大型成套設備的出口信貸和出口信用保險項目；負責機電產品國際招標活動的協調和監督；負責全市商業科技發展和技術進步。
(13)公平貿易和產業損害調查辦公室
研究提出我市進出口公平貿易的對策並提供咨詢服務；組織協調我市涉及反傾銷、反補貼、保障措施的進出口公平貿易工作及相關案件應訴；建立全市公平進出口貿易預警機制；協助商務部開展國外貿易壁壘和產業損害調查；開展工業國際競爭力調查、工業恢復發展跟蹤評價和工業安全應對。
(14)外國投資管理辦公室
管理全市利用外資工作，參與制定全市外商投資產業目錄；負責外商投資企業設立的監督管理；依法監督檢查外商投資企業執行有關法律、法規、規章和合同章程的情況，指導和協調解決相關問題；指導外商投資企業的進出口工作；負責申報省級以上經濟開發區；指導和協調同級各經濟園區外經貿規範化管理工作。
(十五)外商投資企業管理辦公室(掛外商投資企業協會牌子)
負責宣傳和貫徹有關外商投資企業的法律、法規和政策；為外商投資企業依法經營提供指導、協調和服務；定期總結和報告全市外商投資企業的綜合情況；協調處理外商投資企業的投訴和糾紛調解。
(16)對外經濟合作辦公室
擬訂全市“走出去”發展規劃和鼓勵境外投資和經濟合作的政策措施；負責本市境外投資的監督管理；率先實施境外資源開發、產能轉移、跨境並購等境外投資合作；指導和協調境外經貿合作區建設；負責海外投資的統計、調查和分析；負責對外承包工程、對外勞務合作和設計咨詢的監督管理；牽頭維護境外勞務人員和境外員工的權益，協助處理境外勞務糾紛和突發事件；負責全市對外援助工作；協調和管理我市承擔的各類援外項目、多雙邊政府間經濟技術合作項目、聯合國和外國非政府組織提供的無償援助和贈款項目。
(十七)投資促進辦公室。
(十八)投資促進二司
以上兩個辦公室的職責:招商辦1負責組織協調本市對歐美等國家(地區)的招商活動；投資促進二科負責亞洲、非洲、大洋洲、香港、澳門特別行政區和臺灣省的投資促進活動。負責與中國駐外使領館及其駐中國使領館商務部門的聯絡；負責相關地區國家(地區)經貿政策調研和項目跟蹤，分析招商引資形勢，提供經貿信息；參與相關國家(地區)重要代表團的接待、重大項目的談判和簽約。
(十九)信息辦公室
負責全球信息化、辦公自動化和網站建設；制定商務信息服務系統建設規劃和年度計劃並組織實施；貫徹落實國家利用電子商務開拓國內外市場的政策措施，推動商貿流通企業應用電子商務；負責業務信息的編制和管理；組織業務領域信息化建設的培訓和交流。
按照規定，設立紀委(掛監察室牌子)、黨委、工會、團委。