上海紫竹高新技術產業開發區由閔行區人民政府、上海交通大學、紫江集團、上海聯和投資公司等七家股東單位***同投資組建。於2002年6月25日奠基，壹期規劃面積13平方公裏。2003年，被列為市級高新技術產業開發區；2006年3月，園區通過國家省級開發區審核並予以公告； 2009年9月，被國家發改委授予“上海國家生物產業基地”，被國家商務部和科技部授予“國家科技興貿創新基地（生物醫藥）”。
2009年10月，園區被中組部認定為“海外高層次人才創新創業基地”，被上海市人民政府授予“上海市知識產權質押融資試點園區”，被上海市商務委授予“上海市軟件出口（創新）基地”；2010年12月，中國（上海）網絡視聽產業基地揭牌；2011年3月，被上海市評為“上海品牌園區”；2011年6月，獲得國務院《關於同意上海紫竹高新技術產業園區升級為國家高新技術產業開發區的批復》。2012年12月，被上海市知識產權局認定為“上海市知識產權示範園區”。 隨著高新區建設的推進，形成輻射效應，改善吳涇、老閔行地區的社會綜合水平。與浦東新浦江鎮建設形成互動，使之成為上海西南、黃浦江沿線又壹亮點。