申請專利去的部門是：國家知識產權局。
申請人申請專利時，應當將申請文件直接提交或寄交到國家知識產權局專利局受理處（以下簡稱專利局受理處），也可以提交或寄交到國家知識產權局設立的專利代辦處。
目前在北京、沈陽、濟南、長沙、成都、南京、上海、廣州、西安、武漢以及鄭州、天津、石家莊、哈爾濱、長春設立國家知識產權局專利代辦處；國防專利分局專門受理國防專利申請。
國家知識產權局是國務院直屬機構，為副部級。貫徹落實黨中央關於知識產權工作的方針政策和決策部署，在履行職責過程中堅持和加強黨對知識產權工作的集中統壹領導。
2023年3月，中***中央、國務院印發了《黨和國家機構改革方案》。將國家知識產權局由國家市場監督管理總局管理的國家局調整為國務院直屬機構。
專利申請不予受理的情況
1、專利申請未以書面形式提出，或者未用中文書寫的不能受理。例如：用模型、樣品、錄像帶、磁盤或者通過電話提出專利申請是不能受理的，未經翻譯的外文申請文件也不能受理。
2、申請文件（包括請求書）未打字、印刷，或者字跡不清、有塗改的；附圖或外觀設計圖片未用繪圖工具和黑色墨水繪制，或者模糊不清（外觀設計照片）、有塗改的不能受理。例如：用鉛筆繪制的附圖和圖片、模糊不清的照片是不能受理的。
3、基本申請文件不齊備，如發明申請缺請求書、權利要求書、說明書中任壹項的；實用新型專利申請缺請求書、權利要求書、說明書、附圖中任壹項的；外觀設計專利申請缺請求、圖片或者照片中任壹項的不能受理。
4、請求書中缺申請人姓名或名稱以及地址不詳的不能受理。
5、專利申請類別（發明、實用新型或外觀設計）不明確或者無法確定的不能受理。
以上內容參考百度百科-國家知識產權局