世貿組織的最高決策機構是部長理事會，至少每兩年召開壹次會議。設有總理事會和秘書處，負責世貿組織的日常會議和工作。總理事會下設貨物貿易、非貨物貿易(服務貿易)和知識產權三個理事會，以及貿易和發展及預算兩個委員會。總理事會還有壹個貿易政策核查機構，負責監督所有委員會，並負責起草國家政策評估報告。為美國、歐盟、日本和加拿大每兩年起草壹份政策評估報告，為最發達的16國家每四年起草壹份，為發展中國家每六年起草壹份。上訴法院負責仲裁成員之間的分歧。
與它的前身關貿總協定相比，世貿組織涵蓋貨物貿易、服務貿易和知識產權，而關貿總協定的知識用於貨物貿易。
WTO是壹個國際貿易組織，其宗旨是公平、公正地處理各國貿易活動中產生的爭端，建立平等互利的健康的國際貿易秩序。然而，在美國出口歐盟的牛肉使用激素壹案中，我們不難發現，盡管世貿組織不斷完善規章制度，但仍有許多國家和經濟體，出於各種原因，尋找各種借口，不遵守貿易條款。雖然壹些權威認證機構可以通過實驗等方法證明交易的產品完全符合要求，但交易者還是會通過其他因素來控制貿易。