2000年集團投資了上海復旦張江生物醫藥股份有限公司（HK8231），委托通用醫控公司管理。復旦張江公司主要從事具有自主知識產權的高科技醫藥產品的研發，2002年該公司在香港創業板上市。
2001年集團入股海南同盟制藥有限公司，成立了海南通用同盟藥業有限公司，委托通用醫控公司管理。海南同盟公司主要從事基因工程藥物、生化藥物等新藥的研發、生產和銷售，擁有通過國家GMP認證的片劑、軟硬膠囊、小容量註射劑、凍幹針劑及基因工程車間等現代化生產線及覆蓋全國的營銷網絡體系。
2001年集團收購海南三洋德林藥業有限公司，成立了海南通用三洋藥業有限公司。三洋公司主要產品耐酶高效抗生素等系列產品在國內市場具有較強的競爭能力和較高的市場占有率；該公司擁有青黴素類、頭孢類、非青非頭的粉針、凍幹粉針、水針、膠囊和顆粒劑等現代化生產線，並整體通過了國家GMP認證。經資產置換，已配置至中國醫藥保健品股份有限公司（SH600056），並且成為其最主要的生產企業。
2004年，集團完成了對西安利君制藥公司部分股權的收購。
2006年，通用醫控公司通過控股湖北鑫益公司間接控股湖北科益藥業股份有限公司。該公司承繼了湖北醫工院的研發資源，其產品的生產工藝和質量控制在國內同類企業中處於領先水平，特別是以更昔洛韋為代表的抗病毒類品種，擁有較高的品牌知名度和市場優勢地位。