專利申請方面，專利類型有三種，分別是發明、實用新型和外觀設計。如果需要保護藥酒配方，只能申請發明專利。如果要保護藥酒包裝瓶，可以申請外觀設計專利。
無論申請哪壹種類型，都需要：
您提供專利申請文件，提交至國家知識產權局專利局，繳費，等待審查員審查。
如果是藥酒配方的發明專利，還需要經過實質審查，審查員壹般會下發審查意見，需要您進行答復（審查意見可能多次，相應的答復也應該是多次），最終獲得專利授權，或者專利申請被駁回，整個申請流程結束。
如果是外觀設計專利，則只經過初步審查，授權較為容易。
專利申請文件是體現您想要保護的藥酒的法律文件，申請文件壹旦提交至專利局，將不允許做任何增加和影響到實質內容的其他修改，所以如果想要有力地保護該藥酒，申請文件撰寫要十分慎重，否則可能既沒有獲得專利保護，還把技術方案公開於社會任其他人隨意無償使用的後果。
另外，本人對申請國藥準字號要走哪些程序不太了解，在此就不做回答了，抱歉。
科易專利為您解答，希望能幫助到您！