1.於文軒:《典型國家節能法律制度及其借鑒意義——以氣候變化為背景》，《中國政法大學學報》第6期，2015。
2.於文軒:《論我國石油儲備法律機制的構建》，《中國政法大學學報》第6期，2014。
3.於文軒:“我國環境監測立法的問題與完善”，載《環境與可持續發展》第2期，2014。
4.於文軒:《環境健康損害賠償:美國實踐及其借鑒意義》，《甘肅政法學院學報》第4期，2013。
5.於文軒:“借鑒國外環境保護立法經驗”，《環境保護》，第16期，2013。
6.於文軒:“確立氣候資源所有權不利於可再生能源產業健康發展”，《中國政法大學學報》，第6期，2012。
7.於文軒:《美國能源安全立法及其對中國的借鑒意義》，《中國政法大學學報》第6期，2011。
8.於文軒:《自然資源產權:政策傾向與調整手段》，《山東科技大學學報(社會科學版)》，第1期，2012。
9.於文軒:“環境法的價值追求與個性表達”，載許主編。《中國環境法評論(第七卷)》，科學出版社，2011版。
10.於文軒:《中國綜合性油氣立法初探》，肖國興、葉榮思主編:《中國能源法研究報告》，法律出版社，2010。
11.於文軒:《油氣法基本原則解析——以氣候變化為背景》，載於中國社會科學院法院法學研究所社會法研究室:《2009年中國環境法治》(上)，法律出版社，2010年3月。
12.於文軒:《環境行政處罰:規則完善與困境解決》，《環境保護》，第6期，2010。
13.於文軒:《論生物安全法的風險防範原則》，薛大元主編:轉基因生物風險評估與安全管理，中國環境科學出版社，2009年。
14.於文軒:《生物多樣性的知識產權保護:國際視角與中國應對》，徐·:中國環境資源法學評論(2008年卷)，人民出版社，2009年7月。
15.於文軒:《環境損害賠償的無過錯責任原則及其與相關機制的協調》，《上海政法學院學報》2009年第6期。
16.於文軒:《生物安全法的秩序價值分析》，載《中國環境法治》，2008年，法律出版社，2009年6月。
17.於文軒:《生物安全法的效率價值分析》，《清華法學》2009年第3期。
18.於文軒、王燦發:“對我國環境法教學模式的反思與探索”，《當代法學》2009年第2期。
19.王燦發、於文軒:“論我國環境法的課程與教材建設”，《當代法學》2008年第6期。
20.於文軒:《我國動物遺傳資源立法存在的問題及對策》，常繼文、保羅·利特爾費爾主編:《動物福利法治:焦點與難點》，法律出版社，2008年。
21.於文軒:《中國生物安全應急處理體系的現狀與完善》，許主編:《中國環境資源法學評論》(2007年卷)，人民出版社，2008年。
22.於文軒:“生物安全法的正義價值分析——以羅爾斯的正義理論為視角”，載《法律與商業研究》2008年第2期。
23.於文軒、沈、:“保障與監督:提高環境執法水平的必由之路”，《環境保護》，2008年第2a期。
於文軒:“生物安全損害賠償國際立法研究”，《環境保護》，2007年第7A期。
25.於文軒:“物權法相鄰制度的環境保護功能分析”，載《法學研究生》2007年第3期。
26.於文軒:《論轉基因生物應急處置體系》，王菽壹主編:《中國可持續發展與環境法治:生態安全及其立法專題研究》，科學出版社，2007年。
27.王燦發、於文軒、李丹、李軍紅:“中國環境立法的困境與出路——以松花江汙染事件為視角”，《中州學刊》2007年第1期。
於文軒:“論環境損害賠償專門立法中的無過錯責任原則”，《法律論壇》2005年第5期。
29.王燦發，於文軒:“圓明園鋪膜事件對環境影響評價方法的質疑”，《中州學刊》，2005年第5期。
30.趙紅梅、於文軒:“環境權的法律概念和法律技術結構分析”，載《法律與商業研究》2004年第3期。
31.王燦發、於文軒:“論生物安全國際法的基本原則”，《現代法律》2003年第4期。
主要英文論文:
1.於文軒:《生物多樣性保護法》，秦天寶:《中國環境法研究手冊》，出版社，2015。
2.於文軒，和:氣候變化對中國土著居民的影響及法律補救。Elizabeth Ann Kronk:氣候變化和土著人民:尋求法律補救，埃德華·埃爾加出版有限公司2013。
3.中國自然資源保護和生物多樣性立法面臨的挑戰。克拉克法學院)第43卷第65438期+0。
4.於文軒，王燦發:中國農業轉基因生物安全立法:現狀、挑戰與對策，佛蒙特環境法雜誌2012(13)。
5.於文軒:低碳與更多:中國煤炭工業立法的挑戰與解決方案，佛蒙特環境法期刊2011(13)。
6.於文軒:中國的生物安全立法，伯克希爾可持續發展百科全書，第7卷:中國、印度、東亞和東南亞:可持續發展評估，伯克希爾出版集團，2012。
7.於文軒:中國生物多樣性保護立法，伯克希爾可持續發展百科全書，第7卷:中國、印度、東亞和東南亞:可持續發展評估，伯克希爾出版集團，2012。