實行“三證合壹、壹照壹碼”登記模式的企業，必須先向稅務機關申報清稅，填寫清稅申報表。企業可以向國稅或地稅的稅務機關申報納稅。稅務機關受理後，應同時將企業完稅申報信息傳遞給對方稅務機關。國稅、地稅稅務機關根據各自職責分別清繳稅款，限時辦理。
清稅完成後，壹方稅務機關及時將本部門的清稅結果信息反饋給受理稅務機關，受理稅務機關根據國稅、地稅的清稅結果統壹向納稅人開具清稅憑證，並在交換平臺共享信息。稅務機關要對納稅人的納稅申報進行分類，擴大即時結算的範圍。根據企業的經營規模、稅收征收方式、納稅信用等級指標等進行風險分析，對風險等級較低的，當場辦理稅務清算手續；如有疑問，企業也可提供稅務中介服務機構出具的鑒定報告。
完稅證明是企業申請註銷登記時，向登記機關提交的所有稅務事項均已結清的憑證。提交完稅證明後要註銷稅務登記，然後需要在報紙上刊登公司即將註銷的公告，然後去工商局註銷公司登記，註銷營業執照。
法律依據
第壹百八十六條清算組在清理公司財產、編制資產負債表和財產清單後，應當制定清算方案，並報股東會、股東大會或者人民法院確認。公司財產在支付清算費用、職工工資、社會保險費用和法定賠償、繳納所欠稅款、清償公司債務後，按照有限責任公司股東的出資比例和股份有限公司股東的股份比例進行分配。清算期間，公司存續，但不得開展與清算無關的經營活動。公司財產在依照前款規定清償前，不得分配給股東。
《公司法》第壹百八十八條公司清算註銷後，清算組應當制作清算報告，報股東會、股東大會或者人民法院確認，並報送公司登記機關，申請註銷公司登記，公告公司終止。