壹、網上申報、繳稅
1、通過“企業電子報稅管理系統”(以下簡稱電子申報軟件)制作生成增值稅電子申報文件。
2、在申報期內通過網上申報系統將申報資料電子數據傳遞到稅務機關，同時在網上申報系統內完成表表之間勾稽關系和進項的比對(在此環節不進行銷項稅額的比對)。
納稅人提交的申報文件各項比對相符的，申報資料信息上報成功，納稅人按系統提示在網上通過ETS劃繳稅款。
3、在網上申報系統成功進行增值稅申報的，納稅人應通過網上申報系統的報表查詢功能查詢打印相關增值稅申報報表。
二、(上門)報稅
納稅人在網上完成申報繳稅後，在申報期限內到稅務機關辦理報稅、銷項、稅款的比對和IC卡的解鎖等業務。
納稅人到稅務機關報稅之前，在稅控機上將金稅卡中本月開具專用發票明細與統計數據抄到本機稅控IC卡上。(即抄稅)
1.報稅資料：
(1)稅控IC卡
(2)打印的本月銷項發票的匯總表與明細表。
(3)當月開出的所有記賬聯紙質資料(采用 “存根聯補錄報稅”的方式進行抄稅的納稅人須提供)。
網上申報納稅人到稅務機關前臺只需辦理報稅和銷項的比對，因此可不攜帶申報文件。同時納稅人應向稅務機關提供網上已完成申報並通過網上辦稅系統打印的紙質申報資料，在紙質申報表的左上角有“國稅網上辦稅”的標誌。
2.報稅及結果處理
稅務機關進入網絡版報稅子系統通過納稅人的IC卡采集納稅人防偽稅控開票系統的開票數據。經審核壹致的，存入報稅子系統，報稅成功。
報稅審核不壹致或因金稅卡或硬盤損壞等原因報稅失敗的，視實際情況處理，必要時納稅人應提供當月開具的全部專用發票，通過存根聯補錄方式進行報稅。