2.充分發揮稅務風險管理組織體系的作用。充分發揮稅務風險管理體系的作用是有效規避企業所得稅匯算清繳稅務風險的核心，這就要求企業以責任制為原則，結合企業自身的特點和戰略目標，健全稅務風險管理組織體系，設置相關的所得稅匯算清繳稅務機構和崗位，以企業的戰略目標為終極目標，善於發現風險，研究產生風險的原因，並及時的提出切實可行的防範措施，切實發揮稅務風險管理組織體系的價值。
3.建立健全稅務風險防範系統。健全的稅務風險防範系統能夠有效的緩解和避免不必要的稅務風險和損失，這就要求企業首先要根據企業自身的特點和戰略目標以及內部稅務風險管理的具體要求，合理的設置企業的稅務管理部門及崗位，做到人人肩上有責任;其次，要細化稅務風險防範體系的內容，涵蓋各項收入、成本、費用以及應交稅務等各個方面的內容;此外，要構建獨立的監管部門，完善相關的獎懲機制，從根本上提高相關工作人員的工作熱情和工作積極性，避免人為因素造成的不必要的稅務風險和壓力。
4.定時檢測和評估企業的內部稅務風險。現階段，企業的所得稅是按年匯算清繳的，所以企業所得稅涉及到企業整個年度的收入、成本、費用、稅金和損失，所以要定期的檢測和評估企業的內部稅務風險，切實的參與到企業整個年度的各項財務活動和經營活動中來，真正發揮組織結構的作用，此外，還要按照企業戰略目標和經營項目的變化不斷的改變和完善企業檢測和評估企業稅務風險的周期，實現企業稅務組織機構價值的最大化，進而實現企業利益的最大化。
5.加強與稅務機關的聯系和溝通。加強與稅務機關的日常聯系和溝通能夠有效的緩解和避免企業在進行所得稅匯算清繳工作中的存在的稅務風險，這就要求企業首先要在日常工作中加強與稅務機關的聯系和溝通，對於匯算清繳工作中遇到的問題和困難要及時的尋求稅務機關的幫助;此外，要積極的向稅務機關學習相關的所得稅法律規範，掌握相關的政策規範，及時了解和掌握相關的政策變化，這樣壹來就能夠有效的避免由於對規範制度的不了解而造成的稅務風險。
6.委托中介機構辦理相關的涉稅鑒證事宜。委托中介機構辦理相關的涉稅簽證事宜能夠加強企業所得稅匯算清繳工作的科學合理性，提高工作效率和工作質量，減少不必要的風險和損失，但是在這個過程中需要註意的是委托具備從事稅務鑒證業務資質的中介機構，比如註冊稅務師事務所等，要求這些機構在辦理涉稅鑒證業務時要依法履行職責，嚴守職業道德，按照稅務機關的要求提供鑒證服務;要與辦理涉稅鑒證業務質量高、信譽好的中介機構進行長期合作，實現***贏。