壹、程序風險:
新時期企業經歷了“三證合壹”、“五證合壹”等新規定。此外，新的稅收政策不斷湧現，對納稅申報、繳納等程序的要求越來越多，要求企業財務人員按照稅務機關要求的程序、時間和相關資料及時辦理，否則會給企業帶來稅務風險。根據《稅收征收管理法》第六十二條規定，納稅人未按照規定期限辦理納稅申報的，可以由稅務機關責令限期改正，處二千元以下的罰款。
二、納稅人身份選擇風險:
納稅人分為壹般納稅人和小規模納稅人，兩種納稅人的計稅依據、計稅方法和稅率不同。壹般納稅人的計稅方法為當期應納稅額=當期銷項稅-當期進項稅，小規模納稅人適用簡易計稅方法。企業身份不同，對業務和稅負的影響也不同，壹般納稅人不能轉為小規模納稅人。因此，應合理規劃納稅人的身份，降低稅收負擔和風險。
三。適用稅率的風險:
許多企業涉及許多不同稅率的業務。比如建築企業給客戶開發票涉及的稅率主要有17%(商品銷售)、11%、6%、3%等。，而酒店餐飲業主要涉及17%(商品銷售)和13%(農產品銷售)。根據財稅[2016]36號文件附件第三十九條規定，納稅人兼營銷售貨物、勞務、無形資產或者不動產，適用不同稅率或者征收率的，應當分別核算不同稅率或者征收率的銷售額；不單獨核算的，適用較高的稅率。因此，納稅人銷售業務存在不同稅率的，應在發票中單獨列明具體項目、免稅金額和稅率，以免增加企業稅負。