深圳市國家稅務局稽查局
1、組織落實稅務稽查法律法規、部門規章及規範性文件，擬訂具體實施辦法。
2、指導、協調本系統稅務稽查工作。
3、組織、協調、督辦稅收違法案件的查處；牽頭組織實施稅收專項檢查和稅收專項整治工作。
4、負責協調公安、檢察、審判機關處理稅務稽查有關工作。
5、負責稽查案件復查工作；負責稅收違法案件舉報管理工作。
6、負責查處稅收違法案件和對納稅人開展系統審計性檢查。
7、組織落實稅務稽查管理信息化建設。
8、組織開展黨風廉政建設、反腐敗工作及行風建設。
9、承辦上級交辦的其他工作。
深圳市國家稅務局車輛購置稅征收管理分局
1、貫徹執行稅收法律法規、稅收征收管理法律法規、部門規章及規範性文件，組織落實稅收征收管理改革；
2、負責車輛購置稅及法律法規規定的基金（費）的征收管理、稅源管理、納稅評估、納稅服務工作，力爭稅款應收盡收；
3、負責車輛購置稅票證管理工作；
4、組織落實稅收收入計劃；負責稅收會計、統計核算工作；
5、組織實施稅收管理員制度；組織落實稅收管理、綜合行政管理等信息化系統的推廣和應用；
6、組織開展黨風廉政建設、反腐敗工作及行風建設；
深圳市國家稅務局直屬稅務分局
1、組織實施進出口貿易稅收管理工作和組織實施出口退稅管理工作，擬訂稅收管理具體實施辦法。負責稅源管理、納稅評估、反避稅和稽查工作。
2、監督檢查稅收執法活動和內部行政管理活動；負責稅務行政處罰聽證、行政復議和行政應訟工作。
3、組織落實納稅服務體系建設；組織實施納稅服務規範和規程；貫徹執行納稅人權益保障規章制度，根據有關規定擬定具體的實施辦法。
4、負責稅收會計、統計核算工作。
5、組織落實稅收管理、綜合行政管理等信息化系統的推廣和應用。
6、貫徹落實進出口稅收政策及管理辦法；組織實施“免抵退”稅管理工作。
7、組織開展黨風廉政建設、反腐敗工作及行風建設。
8、承辦上級交辦的其他工作。
深圳市國家稅務局海洋石油稅收管理分局
1、貫徹執行國家稅收法律、法規和規章，結合實際，研究制定具體的實施辦法。
2、根據實際情況，按照深圳市國家稅務局的統壹部署，研究制定本分局稅收發展規劃、工作計劃並組織實施。、
3、負責深圳市海洋石油企業、金融企業稅收征管、稅源管理和稽查工作。
4、負責本分局所轄納稅人違法違章情況的處理、行政處罰及聽證、行政復議、賠償案件及行政訴訟，調解稅收爭議工作。
5、負責編制本分局稅收計劃，組織開展稅收統計、稅收預測、稅收分析、稅收調研、納稅評估及稅源監控等工作。
6、負責本分局的政務公開、經費和資產管理工作。
7、負責本分局人事、教育和黨群工作。
8、負責本分局黨風廉政建設和紀檢、監察工作。
9、承辦上級交辦的其他工作。 信息中心、機關服務中心、稅收科學研究所、註冊稅務師管理中心、票證中心