1、職責不同。稅務稽查負責涉稅涉票案件的舉報受理、案件查處、重點稅源戶的檢查、每年上級安排的專項檢查。稅務征管人員只負責日常的辦證、申報、領購發票、納稅輔導等。
2、工作重點不同。稅務稽查的重點是納稅檢查和監督，如發票協查，結稅結票，行政處罰，稅收保全和強制執行等
稅務征管的重點是稅務管理，主要是宣傳、送達和咨詢輔導，稅務登記和認定，核定申報方式和納稅定額，發票管理，交叉稽核。
3、所屬機構不同。稽查局只是市地稅局下屬的壹個機構，如同其他地稅分局壹樣，只是稽查局的工作內容和其他分局不同。其他地稅分局主要從事稅收的征收管理工作，而稽查局則是專門從事稅務檢查工作。
納稅評估和稅務稽查的區別：
1、納稅評估與稅務稽查的目的不同
納稅評估主要是通過對納稅人當期稅源真實性的評估，提高納稅人依法履行納稅義務的能力，同時提高稽查選案的準確性。稅務稽查的目的主要是查處偷稅、騙稅等稅收違法行為，保障稅收，促進依法納稅和稅收秩序的好轉。
2、主體和客體不同
納稅評估主要是由基層稅務機關的稅源管理部門和稅收管理員負責；客體主要是指當期管理範圍內的所有納稅人、扣繳義務人的納稅活動。稅務稽查由稅務稽查局負責，主體簡單明確；客體針對性較強，主要指有偷稅、逃避追繳欠稅、騙稅和抗稅等稅收違法嫌疑的納稅人或扣繳義務人的各項活動。
3、工作程序和工作地點不同
納稅評估的程序是，確定對象—實施分析—詢問核實—評估處理—反饋建議和維護更新稅源管理數據，這決定了納稅評估壹般在稅務機關辦公場所開展。稅務稽查的程序要復雜得多，壹般在稅務機關辦公場所和稽查對象現場開展。
4、具體作用不同
服務是納稅評估的職能，懲處、威懾和教育是稅務稽查的職能。稅務稽查主要通過懲處等打擊性措施起到執法作用。納稅評估是稅收管理的第壹道防線，稅務稽查是最後壹道防線。
綜上所述，稅務機關在實施稅務稽查時，有權“詢問納稅人，扣繳義務人納稅或代扣代繳代收代繳稅款有關的總是和情況。
法律依據：
《中華人民***和國稅收征收管理法》
第三十二條
稅務機關在實施稅務稽查時，有權“詢問納稅人，扣繳義務人納稅或代扣代繳代收代繳稅款有關的總是和情況”。也可以對當事人、見證人或其他有關知情人，了解相關情況。