查稅的基本程序是：
壹、選案：根據案源信息篩選，決定是否立案
二、立案
接下來，如果符合條件就要進行立案，立案之後就是檢查程序，根據檢查結果制作《稅務稽查報告》。實施檢查之日起60日內完成，確需延長檢查時間的，應當經稽查局局長批準。
最後就是審理程序，檢查完畢，檢查部門應當將《稅務稽查報告》、《稅務稽查工作底稿》及相關證據材料，在5個工作日內移交審理部門審理，並辦理交接手續。
審理部門接到檢查部門移交的《稅務稽查報告》及有關資料後，應當在15日內提出審理意見，但下列時間不計算在內：
（壹）檢查人員補充調查的時間；
（二）向上級機關請示或者向相關部門征詢政策問題的時間。
案情復雜確需延長審理時限的，經稽查局局長的批準，可以適當延長。
法律依據：《稅務稽查工作規程》第二十五條規定
調取賬簿、記賬憑證、報表和其他有關資料時，應當向被查對象出具《調取賬簿資料通知書》，並填寫《調取賬簿資料清單》交其核對後簽章確認。
調取納稅人、扣繳義務人以前會計年度的賬簿、記賬憑證、報表和其他有關資料的，應當經所屬稅務局局長批準，並在3個月內完整退還；調取納稅人、扣繳義務人當年的賬簿、記賬憑證、報表和其他有關資料的，應當經所屬設區的市、自治州以上稅務局局長批準，並在30日內退還。