主體不同，稅務稽查的主體是稅務專業稽查機構，稅收檢查的主體可以是各類稅務機關，只不過征收、管理機構所從事的稅收檢查活動實際上是其管理活動的組成部分；對象不同，稅收檢查的對象可以是所有的納稅人和扣繳義務人，只要稅務機關認為有必要即可對其納稅和扣繳情況進行核查；而稅務稽查的對象是依據舉報或科學選案而確定的有涉嫌違法行為的納稅人、扣繳義務人。稅務稽查與稅務檢查的主要區別有主體、對象、程序、目的等四個方面。稅務稽查是稅務檢查和處理工作，但是對這種稅務檢查加了限定性的定語，稅務檢查相對稅務稽查範疇較大。稅務檢查是稅收征收管理的壹個重要環節，是指稅務機關依法對納稅人履行繳納稅款義務和扣繳義務人履行代扣、代收稅款義務的狀況所進行的監督檢查。稅務稽查壹般是指稅務機關嚴格按照相關法律法規的規定，依照法定程序對納稅人、扣繳義務人的涉稅情況進行檢查處理的活動。
法律依據：《中華人民***和國稅收征收管理法》
第壹條 為了加強稅收征收管理，規範稅收征收和繳納行為，保障國家稅收收入，保護納稅人的合法權益，促進經濟和社會發展，制定本法。
第二條 凡依法由稅務機關征收的各種稅收的征收管理，均適用本法。
第三條 稅收的開征、停征以及減稅、免稅、退稅、補稅，依照法律的規定執行;法律授權國務院規定的，依照國務院制定的行政法規的規定執行。
任何機關、單位和個人不得違反法律、行政法規的規定，擅自作出稅收開征、停征以及減稅、免稅、退稅、補稅和其他同稅收法律、行政法規相抵觸的決定。
第四條 法律、行政法規規定負有納稅義務的單位和個人為納稅人。
法律、行政法規規定負有代扣代繳、代收代繳稅款義務的單位和個人為扣繳義務人。納稅人、扣繳義務人必須依照法律、行政法規的規定繳納稅款、代扣代繳、代收代繳稅款。
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