稅務內控管理應遵循有合法性原則，完整性原則，可靠性原則等。
1、合法性原則：稅務內控管理應遵循國家稅收法律法規和政策，確保稅務活動的合法性。
2、完整性原則：稅務內控管理應確保稅務活動的完整性，防止數據丟失、篡改等問題。
3、可靠性原則：稅務內控管理應確保稅務活動的可靠性，防止虛假報稅、偷稅漏稅等行為。
4、保密性原則：稅務內控管理應確保稅務活動的保密性，防止稅務信息泄露。
5、可控性原則：稅務內控管理應確保稅務活動的可控性，實現對稅務活動的監督和管理。
6、效率性原則：稅務內控管理應確保稅務活動的高效性，提高辦稅效率，減少企業辦稅成本。
內部控制制度按其控制內容，可分為多個方面的內部控制，如現金的內部牽制制度、銷售和收款循環的內部控制制度等。納稅內部控制制度是整個內部控制制度中的壹部分。
內部納稅控制制度簡介：
在實行統收統支的計劃經濟體制下，國家征收的稅種較少，納稅人對內部納稅控制極不重視，許多納稅人未建立，或僅有不健全的內部納稅控制制度。這在當時的環境下，對納稅人，對國家的稅收收入都未產生影響。
但隨著我國新稅制的出臺並施行，稅收體系與稅收征管體系已建立並逐步完善。這種外部經濟環境的變化，要求納稅人相應地建立內部納稅控制制度。如果沒有健全的內部納稅控制制度，勢必影響納稅會計提供資料的正確性和可靠性，影響納稅籌劃的進行。
每個納稅人都應從成本效益的角度出發，建立健全內部納稅控制制度。實施內部納稅控制制度可以提高納稅會計核算資料的可靠性。內部納稅控制制度要求各項有關的納稅活動都按授權進行。在此基礎上提供納稅核算資料必然具有壹定的準確性和可靠性。