營業稅和增值稅的壹個本質區別為營業稅為價內稅，而增值稅為價外稅，營業稅下銷售方收到的款項就是銷售價款；而增值稅下銷貨方收到的貨款包括銷售價款和稅款。在這裏，“價”可以理解為“銷售價款”，銷售價款即為計稅基礎。
（二）計稅方法的區別
營業稅下的計稅方法為應納稅額=營業額×稅率，對於建築施工企業來講也就是工程造價或者業主計價款乘以適用稅率3%；增值稅的計稅方法為應納稅額=當期銷項稅額－當期進項稅額，其中當期銷項稅額=不含稅銷售額×稅率，所以我們先要把含稅銷售額轉換為不含稅銷售額，也就是用含稅銷售額÷（1+稅率）換算為不含稅銷售額以後，再乘以11%，這樣才是銷售稅額，那麽進項稅額就是在購買材料、機械等行為中取得的進項稅額專用發票。
而進項稅額又分為準予抵扣和不準予抵扣兩種情形，判斷了壹項經濟行為屬於準予抵扣範圍後，接下來就要看抵扣憑證的類型。
對於建築施工企業來講，轉變為增值稅後，計稅方式為應納稅額=當期銷項稅額-當期進項稅額，其中當期銷項稅額就是投標報價確定的建造合同收入，收入換算為不含稅收入乘以適用稅率就為我們的銷項稅額，進項稅額就是從當期采購材料、勞務分包等來取得進項稅額。
例如：建造合同1000萬，材料、機械租賃費650萬（假設均取得符合抵扣的發票），銷項稅率11%，進項稅率17%。
（三）納稅方式的區別
營業稅的納稅方式為勞務發生地納稅，增值稅的納稅方式為機構所在地，營改增後建築施工企業預計會采用匯總納稅方式，也就是就地預交、匯總繳納。
（四）納稅管理的區別
營業稅制下為單壹環節納稅，計算簡單，征收管理簡單，所得稅前可以扣除；增值稅制下為兩個環節、全過程納稅，存在增值稅鏈條，計算復雜，征管嚴格，所得稅前不得扣除，而且增值稅為環環抵扣制，計稅依據為流轉環節的增值額。營業稅計稅依據為流轉環節的銷售（營業）額。
增值稅計征復雜、征管嚴格、法律責任重大。
1.增加稅收管理環節、擴大管理平臺、增強管理職能使稅收管理更加嚴密、嚴格。
2.以票管稅，鏈條管理，嚴管嚴控，以“金稅工程”網絡管理體系輻射全國，開票、發票認證、抵扣、納稅申報、後臺評估等多種手段進行納稅管理。
3.發票管理嚴格，存在觸犯刑法等。
起征點
《國家稅務總局關於小微企業免征增值稅和營業稅有關問題的公告》(國家稅務總局公告2014年第57號)明確，對於以壹個季度為納稅期限的納稅人，季度銷售額不超過9萬元(含9萬元)的，免征增值稅。對於按季申報的納稅人，季營業額不超過萬元(含9萬元)的，免征營業稅。
就是季度收入不超過9萬元的企業，是收入，要好好註意開發票哦。
稅率如何
這個取決於不同的行業類型了，有3%，6%，17%等等。
如何合理的做賬？
這個問題太長了，要具體問題再看的，有興趣可以看之前發的賬務處理的內容。
納稅基礎
納稅的標準先看營業額，上面講過了，實際繳稅是按照應納稅所得額計算的。