只有會計處理和稅務處理保持各自的獨立性，才能保證會計信息的真實性和應納稅額的準確性。
《稅收征管法》第二十條規定：“納稅人、扣繳義務人的財務、會計制度或者財務、會計處理辦法與國務院或者國務院財政、稅務主管部門有關稅收的規定抵觸的，依照國務院或者國務院財政、稅務主管部門有關稅收的規定計算應納稅款、代扣代繳和代收代繳稅款。”
《企業所得稅法》第二十壹條規定：“在計算應納稅所得額時，企業財務、會計處理辦法與稅收法律、行政法規的規定不壹致的，應當依照稅收法律、行政法規的規定計算納稅。”因此，在進行會計核算時，所有企業都必須嚴格執行會計制度（企業會計制度、會計準則等）的相關要求，進行會計要素的確認、計量和報告。在完成納稅義務時，必須按照稅法的規定計算稅額，及時申報繳納。
二、會計與稅法的差異的處理方法
1.納稅調整
流轉稅：流轉稅需要納稅調整的項目，例如銷售貨物、轉讓無形資產、銷售不動產、提供應稅勞務時向客戶收取的違約金、延期付款利息、集資款、手續費、代收款項、代墊款項等。又如房地產企業取得的預收賬款需並入當期營業額計征營業稅。流轉稅按月計征，月末按照稅法規定計算出應納稅額提取並申報繳納。
所得稅：企業所得稅和個人所得稅（指個人獨資企業、合夥企業、個體工商戶的生產、經營所得）實行按月或按季預繳，年終匯算清繳，多退少補的征收方式。企業在報送年度所得稅納稅申報表時，需要針對會計與稅法的差異項目進行納稅調整，調整過程通過申報表的明細項目反映。