新疆解放前，五家渠、梧桐窩子、蔡家湖是只有幾十戶人家的自然村，隸屬米泉、昌吉兩縣的區鄉管轄，沒有地方行政機構。
1949年9月，新疆和平解放。中國人民解放軍第六軍第十七師進駐迪化特區各縣，幫助地方政府建設黨政，開墾土地進行生產，建立軍墾農場。
中華人民共和國成立後，先後建立了金夢、八壹、十六團和農六師五家渠三個軍墾農場。行政區劃仍屬米泉、昌吉兩縣，工商、稅務由兩縣管理。其他司法行政事務由新疆軍區生產建設兵團師、團管理。
1953年，17師更名為農6師，師部由迪化遷至五家渠。五家渠當時是壹個三五戶人家的自然村。隸屬農六師的金夢農場，五家渠南北耕地，甘德縣梧桐窩子八壹農場，蔡家湖十六農場(跨甘德、昌吉兩縣)。
1954年2月，甘德縣更名為米泉縣，同年7月，昌吉回族自治區成立。
1955年改為昌吉回族自治州，隸屬於昌吉回族自治州(地)所轄的米泉縣和昌吉縣。
1975，農六師建制撤銷後，團場隸屬昌吉回族自治州。
1978後，昌吉回族自治州政府在五家渠分別設立工商、稅務、物價監督、質量技術監督機構，管理五家渠及101團、102團、103團的上述行政事務。
1982，兵團成立，農六師恢復後，該團回到農六師。師部所在地五家渠成為新疆生產建設兵團管理的特別行政區劃，地方政府通過工商、稅務等機制行使政府的部分職能。
1983、1997年，昌吉、米泉分別撤縣設市，地區仍歸兩市管轄。
根據中央、國務院中發1997《關於農六師五家渠設立自治區直轄縣級市的文件》精神，1998+0成立五家渠市籌委會。
2002年9月，國務院批準新疆維吾爾自治區設立縣級五家渠市。六師所屬三個團，即101團(全部)、102團(大部分)、103團(大部分)，五家渠師(全部)從原米泉市、昌吉市分離出來，組成五家渠市。
2003年6月5438+2月31日，自治區人民民政廳發布《關於設立五家渠市(縣級)有關問題的通知》。
2004年6月65438+10月65438+9月，經自治區人民政府批準，五家渠市掛牌成立。
2004年6月65438+10月65438+9月，五家渠成立。六師與五家渠市黨政、事業單位整合，按相應法定程序設立人大和CPPCC。五家渠市城區有3個街道，3個團，101團，102團，103團。
2012，102團和103團分別建立吳彤鎮和蔡家湖鎮。
2013五家渠轄軍墾路、清湖路、人民路三個街道，101號(與五家渠清湖生態經濟開發區合並)、102號、103號三個團場？
2021 12年2月22日，兵團正式批準設立五家渠市清湖鎮(漢[2021]40號)。鎮政府位於北京路3269號，鎮域面積51.22平方公裏。這是繼2012吳彤鎮、103蔡家湖鎮之後，五家渠市設立的第三個鎮。
到2022年，五家渠市轄3街3鎮1國家級經濟開發區:軍墾路街道、清湖路街道、人民路街道、清湖鎮、吳彤鎮、蔡家湖鎮、五家渠經濟技術開發區。