1、申報時間不同
季報的時間是在季度結束的次月，而月報是在月度結束的次月。季報在月度結束以後，不需要進行報表的申報。企業的報表如果是季報，企業的會計憑證也可以壹個季度整理壹次，而月報需要每月申報上月的財務報表。企業不管這個月的業務怎麽樣，即使壹筆收入也沒有，都需要申報財務報表。
2、報表數據不同
季報的時候，資產負債表是季度末的數據，利潤表是季度的累積，月報的數據是月份的數據。因為數據的不同，對企業的後期核查也會產生不同的影響。月報出現問題，很容易找出原因，而季度報相對可能比較麻煩點。
小規模納稅人季度申報流程
(1)小規模納稅人申報時比須先抄報稅後，方可正常申報，未進行稅控設備抄報稅的納稅人無法網上申報;
(2)申報時應準確填寫申報，符合系統比對規則後方可正常申報。
對申報比對不通過的要按系統提示準確修改申報數據，符合系統比對後方可正常上傳申報數據;
(3)納稅人正常比對通過後，可正常清卡解鎖。
若納稅人申報時經反復核對仍無法正常申報，則可按照系統提示正常上報但暫不扣繳稅款，攜壹證通、稅控設備、增值稅申報表、營業執照、經辦人身份證到辦稅服務廳辦理相關申報事宜。
法律依據
《中華人民***和國企業所得稅法實施條例》
第壹百二十八條 企業所得稅分月或者分季預繳，由稅務機關具體核定。
第五十四條 企業所得稅分月或者分季預繳。企業應當自月份或者季度終了之日起十五日內，向稅務機關報送預繳企業所得貌納稅申報表，預繳稅款。企業應當自年度終了之日起五個月內，向稅務機關報送年度企業所得稅納稅申報表，並匯算清繳，結清應繳應退稅款。企業在報送企業所得稅納稅申報表時，應當按照規定附送財務會計報告和其他有關資料。