●自然碼雙拼第壹版方案在1988年設計完成，拼音部分以當時流行的UCDOS壓縮拼音為基礎，經過大量統計和對比測試將常用韻母安排在最方便的地方，並且同時滿足韻音與字母音相關，便於記憶。
●輔助碼以偏旁部首的發音為基礎，避開了零聲母不適合做簡碼的弊病。其編碼僅用了26個字母和4個符號，在當時的情況下，比其他流行的編碼具有非常大的優越性。其單字重碼率與五筆基本相當，易學性卻大大降低。在軟件設計上也是有很多獨創。如：“無重碼自動頂出”、“輔助碼預提示”等。 ●首次提出“以單字為基礎、詞組為主導、智能化處理”的漢字輸入新概念，引導用戶從依賴打字員的專業打字模式逐步進入聽想輸入模式。而當時其他輸入法還在爭奪“最低重碼率”和“最高輸入速度”。普通拼音類輸入法還在使用低效率的“單字聯想”功能。
●首創自動記憶功能和允許含有英文、數字、符號等造詞功能。可在輸入中直接創建自造詞，並且不需要人工幹預，可以自動保存。而當時的其他輸入法軟件只能用自帶編輯方式添加詞匯，且編碼不能含有符號，內容也不能有非漢字內容，長度也不能超過10個）。 ●1993年自然碼5.4版獲得國家科委向全國推薦（國家科委(93)國科成辦字第032號文件 “推薦采用自然碼漢字輸入系統”的通知）
●授權希望電腦公司UCDOS捆綁銷售
●成為國家新標委推薦的標準化漢字輸入法
●成為國家教委計算機等級考試、計算機自學考試和公務員計算機考核的推薦輸入方法
3.5 授權微軟Windows使用自然碼雙拼（1994年） 微軟公司Windows3.X轉Windows95的時候由於之前3.X所使用的四通雙拼（四通打字機上，後也稱為WPS或拼音加加雙拼）無法取得合法授權，在經過多方考察後，決定使用除四通雙拼之外在當時影響最大設計方案最好的自然碼雙拼。但由於從四通雙拼無法直接轉換為自然碼雙拼，不得不沿用原來的零聲母方案且多壹個分號做編碼，非常遺憾。 ●根據國家語委《信息處理用GB13000.1字符集漢字部件規範》重新設計新的編碼方案，不再使用符號鍵作為筆畫和部首的編碼，大大提高了易學性，同時可采用多重選擇方式輸入會意字和部首位置不明顯的漢字，改善了取碼不定等問題。經過改進後的形碼采用“切音”法，將漢字拆分成兩個成字部分，並用部件的雙拼做為編碼，不但可快速輸入認識的漢字，也可方便地輸入不認識的漢字，很好地解決了以往音碼方式下的大字符集漢字和難字的輸入問題。新編碼經過測試符合國家規範標準，申請國家專利：98101731.2。
●首創GBK“雙拼切形”和“全拼切形”，只要將漢字壹分為二，不用背字根或數筆畫，利用偏旁部首的雙拼或全拼進行組合，可輕易輸入任何不認識的難字。
●首創“屏幕取詞造詞”功能，可以在屏幕上用鼠標框住任何壹段文字，直接將其造詞，造詞編碼自動出現，並可手工修改。
●首創多詞庫掛接功能，提供大量專業詞庫：成語大全、地名大全、醫學詞庫、法律法規、辦公出版、文學寫作、電腦、軍事、金融股票、財會稅務、中小學教育詞庫。基本詞庫與專業詞庫可隨意組合，由用戶選擇可同時掛接多個需要的詞庫。 ●與王磊、何公道、李振欣、高巖文等合作完成第壹個會說話的輸入法，輸入過程中語音即時提示（同步朗讀），可對整篇文章閱讀和校對（光標跟隨），還可對數字鍵盤語音提示（按鍵音）及整篇數字朗讀校對（跳過非數字）。
●首創整篇文章自動學習、自動搜索造詞，也可批量造詞，有動態和靜態兩個自造詞庫，靜態庫容量可超過1G，相當於無限量。
●針對BIG5設計的繁體字詞庫，真正港臺習慣，絕非轉換可比。
●完成詞語連續輸入模式，既有字詞輸入的優點又有語句輸入的長處。
●首創漢語拼音分字詞智能轉換功能，將漢字轉換為漢語拼音符號（可帶音調或無調），正確處理“壹”、“不”變調，連三音變調等口語化讀音。
●首創“智能識別中文標點”功能。在“中文標點”狀態下，可直接輸入英文數字123.456+34,576-344.25。 ●將原來的16位BC程序經過改進更換為32位VC6程序，使用Unicode底層模塊徹底支持Windows 2000/XP。
●引進黑馬飛騰軟件公司整句識別輸入技術，增強整句識別覆蓋範圍，大大提高初次使用識別率。
●改進黑馬整句識別軟件，改正了多個錯誤，修正了多種由於語料問題而導致的錯誤語句，並且將原來黑馬的整句識別速度提高了3～5倍。
●首創智能內碼轉換（首先切分字詞然後調用壹對多精確轉換）正確率遠超過內碼內碼轉換軟件，並可同時轉換港臺習慣用詞。
●獨創漢字轉編碼、編碼重新轉換或重組功能，可用於會議記錄、完全盲打（無屏幕）之後的後期處理。比微軟拼音中的編碼重組功能更方便和直接，且不需要更改系統設置。
●率先實現漢字信息提示功能，將鼠標放到提示行漢字上停留壹會兒，就可以看到這個字的“同音字、帶調全拼、五筆編碼、區位、內碼”等提示信息。 ●進壹步改進和完善語句功能，首創“自然整句輸入”方式。其特點是既可像微軟拼音、智能狂拼那樣連續輸入，也可加偏旁單獨輸入或修改字詞，還可像智能ABC那樣逐詞選擇，是壹種結合了多種輸入法特點，可以輕松使用的最優方式。
●改進了提示行樣式，支持超強的皮膚定制功能，允許提示行半透明，半陰影。其中顯示漢字可以兩種方式的陰影，背景圖、前景圖均可隨輸入或時間動態改變。
●首創動畫提示行，並且用戶可以自己DIY設計，遠遠超過目前其他輸入法的簡單貼圖方式。
●率先提供化學符號特別庫，可像輸入漢字壹樣輸入化學公式和圖形（雙拼、全拼、五筆皆可）。
N2+3H2? 2NH3
●首創自然整句輸入方式，直接使用’在緩沖行上進行前後定位移動，使用;進行重碼選擇，配合直接輔助碼實現最快修改功能。
●首創長按鍵快速整句修改定位和快速選擇功能，徹底改變了整句輸入修改難的被動局面，將為今後整句輸入法開創新的裏程碑。