1、申領法人營業執照辦理部門：工商行政管理局依據：《合作社登記管理條例》提交材料：設立登記申請書。全體設立人簽名、蓋章的設立大會紀要。全體設立人簽名、蓋章的章程。法定代表人、理事的任職文件和身份證明。全體出資成員簽名、蓋章予以確認的出資清單。法定代表人簽署的成員名冊和成員身份證明復印件。住所使用證明。指定代表或者委托代理人的證明。合作社名稱預先核準申請書。業務範圍涉及前置許可的文件。收費內容：不收任何費用。註意事項：農民專業合作社名稱為：行政區劃+字號或商號+產業類別+專業合作社。農民專業合作社法人營業執照不需要年檢。
2、辦理公章辦理部門：公安局依據：《公安部印章管理辦法》提交材料：合作社法人營業執照復印件、法人代表身份證復印件、經辦人身份證復印件。收費內容：刻章費，根據材料不同，幾十元到壹百元不等。註意事項：目前專業合作社需要的公章有行政章、財務專用章、法人代表章***三枚。
3、申領組織機構統壹代碼證辦理部門：質量技術監督局依據：《++省組織機構代碼管理辦法》提交材料：合作社法人營業執照副本原件及復印件壹份。合作社法人代表及經辦人身份證原件及復印件壹份。如受他人委托代辦的，須持有委托單位出具的代辦委托書面證明。收費內容：證工本費：正本、副本、技術服務費、IC卡工本費。註意事項：合作社自工商局批準成立或核準登記成立之日起30日內辦理組織代碼證。代碼證有效期限為四年，到期須要換證。代碼證實行年檢制度。
4、申領稅務登記證辦理部門：國家、地方稅務局依據：《稅務登記管理辦法》提交材料：法人營業執照副本及復印件。組織機構統壹代碼證書副本及復印件。法定代表人(負責人)居民身份證或者其他證明身份的合法證件復印件。經營場所房屋產權證書復印件。成立章程或協議書復印件。
5、註意事項：合作社應當自領取工商營業執照之日起30日內申報辦理稅務登記，未按照規定期限申報辦理者，可處2000元以下的罰款。稅務登記證定期驗證、換證和年檢，壹年驗證壹次，三年更換壹次。