高新技術企業獲得資格後，企業以“自行甄別、申報享受、留存相關材料備查”的方式享受稅收優惠事項。享受稅收優惠的高新技術企業每年匯算清繳時，應保存以下材料備查:
高新技術企業資格證書；高新技術企業認定材料；知識產權相關材料；年度主要產品(服務)起核心支撐作用的技術屬於國家支持的高新技術領域規定範圍的說明，高新技術產品(服務)及相應收入數據；從業人員和科技人員的年度情況證明；當年及前兩個會計年度的R&D費用總額及其占同期銷售收入的比例、R&D費用管理數據、R&D費用輔助賬戶、R&D費用結構明細表(具體格式見《高新技術企業認定管理指引》附件2)；省級稅務機關規定的其他材料。
標準物質時間覆蓋範圍的要求
企業取得高新技術資格證書後的三年並不是壹勞永逸的，後續的管理工作需要做好。壹般來說，對於企業所得稅的最終匯算清繳，稅務部門很少會直接發起審核。反而是財政部門的科技、環保、安監、審計等部門的例行抽檢更容易發現問題。從2019對某省的抽樣檢查來看，問題主要集中在科技人員、R&D費用、高新技術收入、取得知識產權的時間等方面。許多企業在過去三年的納稅申報表中沒有反映R&D費用；組織的現場抽查答辯通過率很低；在系統調查的知識產權中，篩選出部分企業的知識產權被重復使用...
這裏要明確審查的發起和再認定的時間點。高新技術企業通常在期滿當年申請重新認定，但也不是絕對的。有的企業在資質到期後可能達不到認定要求，次年符合條件後再申請重新認定。與重新評審相比，評審的時間具有隨機性和不確定性:相關部門在日常管理過程中發現不符合評審條件的，會以書面形式提交評審機構進行評審。這個評審觸發時間可能在高新技術企業資格有效期內，也可能在高新技術企業資格期滿後，甚至可能在高新技術企業資格重新認定後。
因此，企業無論是為了以後的重新認證，還是為了應付相關部門的日常管理，都需要密切關註自資質年度起連續三年滾動的相關參考資料的數據質量。
標準物質的質量要求
國科教發[2065 438+06]32號和國科教發[2065 438+06]195號既是企業認證(再認證)標準，也是維修標準。以下是詳細分析:
(1)科技人員
企業職工和科技人員情況說明材料，包括在職、兼職和臨時職工人數、人員學歷結構、科技人員名單及其工作明細、企業職工名單及上年末社保繳費人數證明材料。
有些地區如廣東，不僅要求附上每季度末的企業人員信息、個人所得稅繳納人數匯總數截圖或社保繳納人數證明材料(只有匯總數需要加蓋企業公章)，還要求提供企業科技人員名單及其工作崗位。對科技人員的具體要求需咨詢當地科技部門。
(2)知識產權
壹般來說，承認需要壹個以上的I類知識產權和五個以上的II類知識產權。實際上這個水平只能算達標。就發明而言，發明專利的授權周期比較長，從受理、初審、公布、實質審查到授權，經歷兩三年是正常的。對於申請發明專利較多的企業，要提前做好知識產權規劃。
對於已經獲得專利的企業，年費在申請日之前繳納。專利權人在被授予專利權的當年和以後未按時繳納年費或者繳納金額不足的，應當自年費期滿之日起六個月內繳納，並同時繳納滯納金。繳費時間超過專利申請日不足壹個月的，不收取滯納金。繳費時間超過壹個月的，每超過壹個月，收取當年年費全額的5%作為滯納金。6個月內未繳納國務院發出專利權終止通知書的，除不可抗力事件外(自障礙消除之日起2個月內，至遲自期限屆滿之日起2年內)，專利權人必須在2個月內繳納專利恢復費、年度專利費和當年全年年費25%的滯納金；如果這兩個月不處理，專利權就無法恢復。在維持期內想要放棄專利的企業，要確認專利是否真的沒有必要，放棄是否會影響重新鑒定或常規檢查。
知識產權有多個權利人時，需提供其他權利人同意企業可以使用該知識產權申報高新技術企業的聲明，所有權利人需加蓋公章。等壹下。
(3)用於研發活動的材料
企業在申請高新技術企業認定時，應根據每個研發項目完成時間的不同，提供相應的R&D投資證明材料。
高新政策中沒有強制要求申報企業的R&D項目必須經過政府批準，R&D項目的認定采取“企業征集、專家評判”的原則。但為了增強企業R&D項目的可信度，建議企業積極申報各級政府的科技項目審批，可以使用政府審批的紅頭文件證明其R&D活動。企業應提供“項目名稱+項目組成員”匯總表，並加蓋企業公章。等壹下。
(四)科技成果轉化
量化成果轉化最好達到每年5年以上。雖然這已經是A級了，但考慮到在鑒定過程中，技術專家會對成果轉化的質量提出質疑，適當增加數量是實務界普遍認可的。
科技成果可以不在申請鑒定期，成果轉化必須在此期。產品研發周期方面，比如2020年提出重新認證，認證周期為2017-2019。壹般來說，最後半年是產品試驗和試點測試的時間。因此，在這壹階段要註意成果形成和轉化的期間分布，從19下半年開始發生的支出需要很大程度上計入資本化支出，無形資產要結轉；否則會影響高新技術產品的形成，成果轉化的質量也會大打折扣。
企業近三年科技成果轉化的概況、逐項說明材料及相關證明材料。企業高新技術產品(服務)的科技成果、轉化形式、關鍵技術和技術指標需附具體說明、相關生產批準文件、認證和資質證書、產品質量檢驗報告等材料。等壹下。
(五)企業的高新技術產品(服務)材料
以生產產品所使用的技術領域作為判定為高新技術產品(服務)的依據和理由，同時需要在產品上附上說明材料:
1.高科技產品描述。
2.企業可提供高新技術產品證書、相關專利證書或大額發票。
3.為增強高新技術產品的公信力，建議企業可以參與當地高新技術產品的認定，並獲得高新技術產品證書，作為高新技術產品的權威憑證。等壹下。
(6)R&D活動的管理水平
R&D活動的管理層面其實是壹個綜合工程，企業可以參考以下幾個方面的資料進行整理:(1)制定企業研發的組織管理制度，建立R&D投資的會計制度，編制R&D費用輔助賬；建立了具有相應科研條件的內部科技研發機構，與國內外研發機構開展了多種形式的產學研合作；建立了科技成果轉化的組織實施和激勵制度，建立了創新創業開放平臺；建立了科技人員培養和進修、職工技能培訓、優秀人才引進、人才績效考核獎勵制度。
(七)檢驗部門要求的其他資料。
關於R&D獎金、高新技術口徑和申報數據的實際問題
學術界將R&D費用分為會計口徑、R&D費用加扣除和高確認口徑。但在實踐評估中，壹般認為年度會計報表中的R&D費用總額、高企申報的年度R&D費用結構表中的R&D費用總額、企業所得稅申報的年度R&D費用加計扣除表中的R&D費用總額，其依據基本壹致——這其實是壹種理想狀態。理論作為實踐的指南而存在。在保證符合高新比例的基礎上，企業可以簡化處理，盡量做到高新R&D費用的增加額和金額與納稅申報和財務審計報告所列數據壹致。