公司股份全部質押，也就是說有兩種情況:
壹是大股東缺錢，欠了很多民間貸款，債權人要求公司質押大股東股權；
二是公司缺錢，比如經營不善，或者公司需要增加產能，需要融資。無論是銀行貸款還是民間融資，都有可能要求大股東用股權質押來擔保。
綜上所述，如果大股東缺錢，用股權質押，不好的後果壹般是公司大股東變更，公司繼續經營；如果公司缺錢，不好的後果可能是新的大股東接手，或者公司直接破產清算。
股權轉讓程序
1.領取《公司變更登記申請表》(到工商行政管理局登記大廳窗口)
2.變更營業執照(填寫公司變更表，加蓋公章，整理公司章程修正案、股東會決議、股權轉讓協議、公司營業執照原件及復印件，到工商局登記大廳辦理)。
3.變更組織機構代碼證(填寫企業代碼證變更單，加蓋公章，整理公司變更通知書、營業執照復印件、企業法人身份證復印件、舊代碼證原件到質量技術監督局)。
4.變更稅務登記證(持稅務變更通知到稅務局)
5、變更銀行信息(憑銀行基本賬戶開戶銀行變更通知)
法律依據:《中華人民共和國民法典》
第443條
以基金份額或者股權出質的，質權自出質登記時設立。
質押後，基金份額和股權不得轉讓，但出質人和質權人協商同意的除外。出質人應當向質權人提前清償債務或者交存基金份額和股權轉讓所得價款。