1、征收對象和事項有所區別。
地稅局收所得稅與營業稅:地稅局負責收取營業稅；城市維護建設稅（不包括上述由國家稅務局系統負責征收管理的部分）；地方國有企業、集體企業、私營企業（不包括上述2002年後新辦企業）繳納的所得稅；個人所得稅；資源稅；城鎮土地使用稅；耕地占用稅；固定資產投資方向調節稅；土地增值稅；房產稅；城市房地產稅；車船印花稅；契稅；屠宰稅；地方稅的滯納金、補稅、罰款。
2、領導單位不同，國家稅務局系統由國家稅務總局垂直領導；省級地方稅務局受省級人民政府和國家稅務總局雙重領導，省級以下地方稅務局系統由省級地方稅務機關垂直領導。
擴展資料：
國家稅務局與地方稅務局雖是兩個相對獨立的行政執法主體，有著各自的工作職責和征管範圍，但都是政府的重要經濟職能部門，***同執行統壹的稅收法律和法規，***同面對的納稅人。各地國家稅務局、地方稅務局不斷加強協調配合，整合行政資源，***同致力於征管質量和效率的提高。
建立聯席會議制度，及時交流溝通情況，協調解決工作中遇到的問題。建立信息交換制度，定期交換數據信息，實現信息***享。加強日常征管工作的協作，通過聯合辦理稅務登記證、聯合開展個體工商戶稅額的核定、聯合開展納稅信用等級評定、聯合組織稅收宣傳、納稅咨詢輔導、對同壹納稅人欠繳稅款實行聯合公告、聯合實施稅務檢查以及加強稅收政策執行的溝通協調等方式***同做好對納稅人的服務和管理
參考資料：