電子印章與公章並不是對立的概念，因為公章也可以是電子形式。推測提問者應該是想問電子印章與物理印章相比較有哪些優勢吧。
1、首先關註的，肯定是電子印章與物理印章的安全性對比：
不難看出，電子印章在用印安全方面有如下優勢：
1）印章管理：明確的法律條文為印章使用與管理提供依據；
2）印章使用：數字認證技術確保用印人身份可識別，杜絕印章偷用、盜用、越權使用；
3）真偽鑒定：印章實時鑒定，提升印章使用與管理便捷性。
2、其次是說電子印章與物理印章的使用與管理效率。
互聯網模式之下，企業經營、辦公協同不斷朝電子化信息化的方向發展，快捷高效的用章模式才能更適應瞬息萬變的互聯網辦公浪潮。
物理印章的使用模式此處自然不必贅述（大家都知道~），而契約鎖電子印章技術則以網絡為媒介、以在線形式簡化印章申請使用流程：
1）發起：申請人上傳用印文檔至電子印章系統；
2）審批：印章管理員登錄印章系統審批；
3）完成：執行用印。
而在印章管理環節，傳統物理印章管理模式下，企業壹般采用臺賬的形式記錄用印明細。由於紙質臺賬記錄存在信息不全、易篡改、易丟失等問題，物理印章的審計工作缺乏可靠依據。
與之相比較，電子印章的權限控制與審計模塊中，印章管理員可追溯每壹次用印歷史，為企業有效管理印章使用，審計明細精確到用印人、用印時間、用印文件甚至是用印地址，為企業印章管理與信息安全防範提供可靠依據。